More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1068 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  100 
 
 
398 aa  810    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  67.01 
 
 
402 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  65.66 
 
 
401 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  66.67 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  65.4 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  65.48 
 
 
398 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  62.56 
 
 
409 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  35.54 
 
 
391 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  35.54 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.55 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  35.54 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  35.31 
 
 
400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  35.06 
 
 
400 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  36.46 
 
 
396 aa  222  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  35.66 
 
 
396 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  35.66 
 
 
396 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  36.66 
 
 
395 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  35.99 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  35.28 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 
400 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  35.92 
 
 
396 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  35.92 
 
 
396 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  35.92 
 
 
396 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  35.54 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  35.54 
 
 
403 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  35.54 
 
 
403 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  35.54 
 
 
403 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  35.54 
 
 
403 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  35.81 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  35.54 
 
 
367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  35.54 
 
 
367 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  34.22 
 
 
418 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  32.04 
 
 
394 aa  212  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  34.66 
 
 
396 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  33.25 
 
 
394 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  32.64 
 
 
393 aa  209  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  32.44 
 
 
395 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.78 
 
 
392 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  32.31 
 
 
397 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  34.74 
 
 
397 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  33.6 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  34.44 
 
 
417 aa  196  5.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  31.07 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.02 
 
 
397 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  32.11 
 
 
393 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.34 
 
 
389 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  30.75 
 
 
397 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  34.02 
 
 
395 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  30.42 
 
 
415 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  34.29 
 
 
394 aa  193  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  29.92 
 
 
391 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  36.72 
 
 
397 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  33.76 
 
 
395 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  32.17 
 
 
396 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  31.83 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  31.07 
 
 
392 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  32.72 
 
 
393 aa  189  5e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  32.59 
 
 
422 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  29.52 
 
 
391 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  31.96 
 
 
411 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  31.82 
 
 
389 aa  187  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  34.21 
 
 
403 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  33.25 
 
 
395 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  33.96 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  33.16 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  32.41 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  32.27 
 
 
394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  33.08 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  31.82 
 
 
397 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  29.11 
 
 
399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  33.6 
 
 
396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.67 
 
 
397 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  32.3 
 
 
396 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  28.86 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0139  PUA domain-containing protein  35.13 
 
 
397 aa  182  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  31.28 
 
 
412 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
396 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  29.11 
 
 
399 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  29.11 
 
 
399 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  29.11 
 
 
399 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
391 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  29.08 
 
 
391 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
396 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  28.86 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3440  PUA  33.25 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  29.08 
 
 
391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  30.93 
 
 
397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  30.21 
 
 
394 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  28.86 
 
 
399 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  34.11 
 
 
407 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  32.66 
 
 
400 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  28.5 
 
 
399 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  28.61 
 
 
399 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0887  PUA domain-containing protein  32.45 
 
 
396 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201837  unclonable  0.0000193307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  33.25 
 
 
391 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  28.61 
 
 
399 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  33.33 
 
 
400 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  29.25 
 
 
399 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  28.17 
 
 
394 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>