More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46093 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46093  predicted protein  100 
 
 
839 aa  1735    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  39.6 
 
 
402 aa  170  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  33.22 
 
 
389 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  37.71 
 
 
401 aa  144  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  32.69 
 
 
384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  36.81 
 
 
409 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  36.36 
 
 
390 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  36.36 
 
 
390 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  31.76 
 
 
385 aa  138  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  32.12 
 
 
400 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  39.45 
 
 
318 aa  136  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
402 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1538  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.33 
 
 
399 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37561e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2702  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.33 
 
 
399 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000137033  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  34.48 
 
 
390 aa  132  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3504  SAM-dependent methyltransferase-like protein  36.49 
 
 
398 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00331784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  35.32 
 
 
398 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  29.87 
 
 
399 aa  119  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  30.49 
 
 
399 aa  119  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  29.55 
 
 
399 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  29.93 
 
 
396 aa  118  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  29.55 
 
 
399 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  29.9 
 
 
399 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  29.93 
 
 
367 aa  118  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  30.13 
 
 
399 aa  118  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  29.93 
 
 
367 aa  118  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  29.93 
 
 
391 aa  118  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  29.93 
 
 
396 aa  117  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  29.93 
 
 
396 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  29.22 
 
 
399 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  29.22 
 
 
399 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  29.22 
 
 
399 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  29.57 
 
 
399 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31 
 
 
397 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  29.61 
 
 
396 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  29.61 
 
 
396 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  29.61 
 
 
396 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  29.22 
 
 
399 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  29.61 
 
 
396 aa  115  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  33.58 
 
 
400 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  30.11 
 
 
297 aa  114  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  28.48 
 
 
396 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  28.48 
 
 
396 aa  114  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  28.48 
 
 
396 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  28.84 
 
 
479 aa  114  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.63 
 
 
392 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  32.42 
 
 
391 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  31.02 
 
 
395 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  29.15 
 
 
396 aa  111  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4829  putative RNA methylase  31.48 
 
 
417 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  30.16 
 
 
409 aa  110  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  28.95 
 
 
403 aa  109  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4030  protein of unknown function Met10  31.53 
 
 
552 aa  108  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  30.25 
 
 
389 aa  108  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  30.18 
 
 
560 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  30.39 
 
 
394 aa  107  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  28.62 
 
 
403 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  28.62 
 
 
403 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  28.62 
 
 
403 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  28.62 
 
 
403 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.64 
 
 
738 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  31.64 
 
 
391 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  31.03 
 
 
397 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  29.28 
 
 
400 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  29.28 
 
 
400 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  29.28 
 
 
400 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  29.87 
 
 
393 aa  103  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  29.8 
 
 
394 aa  103  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  31.2 
 
 
398 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  37.13 
 
 
321 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3242  SAM-dependent methyltransferase  29.49 
 
 
397 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.29 
 
 
408 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  30.19 
 
 
393 aa  101  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  27.96 
 
 
415 aa  101  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.4 
 
 
725 aa  100  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  0.0000000000188031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  29.05 
 
 
396 aa  99.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  29.97 
 
 
400 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.41 
 
 
750 aa  99.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  30.42 
 
 
394 aa  98.6  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  37.8 
 
 
762 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  28.35 
 
 
413 aa  98.6  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  31.73 
 
 
393 aa  97.8  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  28.52 
 
 
396 aa  97.8  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0688  putative RNA methylase  32.42 
 
 
734 aa  97.8  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0808112 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  27.03 
 
 
397 aa  97.4  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  30.5 
 
 
394 aa  97.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  28.37 
 
 
397 aa  96.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  29.39 
 
 
395 aa  96.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  30.29 
 
 
404 aa  97.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  28.52 
 
 
394 aa  96.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  30 
 
 
397 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  26.71 
 
 
418 aa  96.3  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  28.04 
 
 
395 aa  96.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  30.42 
 
 
416 aa  96.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.98 
 
 
756 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  28.76 
 
 
393 aa  95.9  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  29.39 
 
 
396 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  28.89 
 
 
404 aa  95.5  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5734  oxidoreductase  33.18 
 
 
365 aa  95.1  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  28.57 
 
 
404 aa  95.5  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0506746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>