More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1873 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  94.93 
 
 		 380 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  98.51 
 
 		 335 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  87.16 
 
 		 335 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  87.16 
 
 		 335 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  87.16 
 
 		 335 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  86.87 
 
 		 335 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  85.89 
 
 		 321 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  77.31 
 
 		 335 aa  553  1e-156  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  74.93 
 
 		 363 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  77.01 
 
 		 350 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  74.03 
 
 		 335 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  74.63 
 
 		 335 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  71.86 
 
 		 353 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  51.49 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  53.1 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  52.05 
 
 		 338 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  50.89 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  50.89 
 
 		 338 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  35.94 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  36.73 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  37.09 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  35.06 
 
 		 302 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  36.36 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  33.2 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  32.62 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  37.78 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  34.66 
 
 		 303 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  26.69 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  26.69 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.33 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  33.94 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  31.67 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  33.83 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  32.01 
 
 		 318 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  26.02 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  25.73 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  26.02 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  26.02 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  25.73 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  26.02 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  26.1 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  33.21 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  33.21 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  31.95 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  31.16 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  25.74 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  33.09 
 
 		 303 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  28.91 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.85 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  33.7 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  28.19 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.7 
 
 		 699 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  29.46 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  30.85 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  27.13 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  26.46 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  31.42 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  31.42 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  29.08 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  29.08 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  31.6 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  30.38 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  29.08 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  32.09 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  32.48 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  29.6 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.71 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.11 
 
 		 701 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  29.28 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3701  protein of unknown function Met10  31.11 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  29.47 
 
 		 396 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  30.54 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  31.03 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.71 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  30.2 
 
 		 479 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  28.72 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  28.87 
 
 		 397 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  34.8 
 
 		 398 aa  99.8  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  30.47 
 
 		 397 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  32.45 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  29.08 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  31.8 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  26.81 
 
 		 411 aa  97.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  31.29 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  30.69 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  26.81 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  27.65 
 
 		 394 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  31.62 
 
 		 408 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  32.08 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  30.69 
 
 		 398 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  28.16 
 
 		 396 aa  95.9  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  27.93 
 
 		 398 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  29.79 
 
 		 400 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  29.5 
 
 		 415 aa  95.9  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  29.09 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  28.52 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>