More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3577 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  68.17 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  69.16 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  67.52 
 
 		 313 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  67.53 
 
 		 318 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  67.97 
 
 		 318 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  68.32 
 
 		 308 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  66.88 
 
 		 320 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  66.56 
 
 		 320 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  67.2 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  62.38 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  59.03 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  58.71 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  57.63 
 
 		 321 aa  360  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  47.68 
 
 		 314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  45.67 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  48.25 
 
 		 308 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  41.75 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  46.55 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  46.9 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  46.62 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  46.28 
 
 		 305 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  46.28 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  47.24 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  45.95 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  45.67 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  45.45 
 
 		 303 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  45.17 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  45.52 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  43.45 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  40 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  44.37 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  46.34 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  44.04 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  44.26 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  46.32 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  42.9 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  42.03 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  37.25 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  31.45 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  31.45 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  31.45 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  31.45 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  31.45 
 
 		 396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  29.67 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.66 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.66 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  31.45 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.66 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  32.76 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 		 396 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  32.08 
 
 		 479 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  28.14 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  32.91 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  36.18 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  28.08 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  33.91 
 
 		 338 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  28.08 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  28.08 
 
 		 396 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  28.91 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  30.65 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  34.17 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  32.88 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  30.65 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  30.65 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  30.65 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  30.65 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  31.74 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  31.61 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  28.4 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  28.82 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  33.18 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  29.55 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  30.99 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.27 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  29.29 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  27.13 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  32.42 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  27.13 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  27.18 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  27.13 
 
 		 399 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  27.13 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.54 
 
 		 560 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  31.88 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  34.81 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  26.12 
 
 		 399 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  33.93 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.95 
 
 		 807 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  30.52 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  35.71 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  30.19 
 
 		 409 aa  99  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  32.44 
 
 		 408 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  26.16 
 
 		 393 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>