More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4481 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  92.31 
 
 		 338 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  82.25 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  77.22 
 
 		 338 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  49.4 
 
 		 380 aa  325  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  50.89 
 
 		 335 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  50.29 
 
 		 350 aa  325  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  50.76 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  50.3 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  50.3 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  50.3 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  50.59 
 
 		 335 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  48.82 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  52.55 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  48.97 
 
 		 335 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  47.08 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  51.55 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  34.16 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  35.92 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  33.63 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  35.61 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  34.94 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  33.54 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  40.22 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  32.64 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  32.23 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.8 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  32.05 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  32.04 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  31.33 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  31.94 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  32.96 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  31.69 
 
 		 305 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  33.92 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  31.31 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  33.57 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  33.53 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  28.18 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  34.24 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  30.09 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  29.52 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  27.84 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  31.67 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  34.17 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  29.73 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  30.04 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  33.21 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  27.37 
 
 		 364 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  29.6 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  29.64 
 
 		 400 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  26.59 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  30.83 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  28.07 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  29.73 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  30.42 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  27.65 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  27.43 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  27.22 
 
 		 413 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  31.69 
 
 		 411 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.32 
 
 		 807 aa  97.1  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  27.4 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  24.75 
 
 		 399 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  27.95 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  24.5 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  31.61 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  32.27 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  25.24 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  27.68 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  30.22 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  29.19 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  27.9 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  29.19 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  24.41 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  24.41 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  24.41 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  30.03 
 
 		 400 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  24.41 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  24.41 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  24.41 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  32.62 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  29.17 
 
 		 393 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  30.03 
 
 		 400 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  30.03 
 
 		 400 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1911  PUA domain containing protein  29.22 
 
 		 396 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  25.7 
 
 		 392 aa  92.4  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  25.88 
 
 		 390 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  25.88 
 
 		 390 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  27.25 
 
 		 433 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  24.08 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1039  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.36 
 
 		 725 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.525642  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  29.52 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  27.3 
 
 		 493 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0528  methyltransferase  26.97 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000817153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  30.52 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  23.99 
 
 		 399 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>