More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4172 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  92.31 
 
 		 338 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  690    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  83.73 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  77.81 
 
 		 338 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  49.7 
 
 		 335 aa  331  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  50.89 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  51.93 
 
 		 350 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  49.7 
 
 		 380 aa  325  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  50.6 
 
 		 335 aa  325  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  49.41 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  48.54 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  49.7 
 
 		 335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  49.7 
 
 		 335 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  49.7 
 
 		 335 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  49.4 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  51.7 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  49.24 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  48.53 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  51.39 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  33.86 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  35.69 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  39.01 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  33.68 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.22 
 
 		 303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  33.45 
 
 		 310 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  36.28 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  33.68 
 
 		 310 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  32.63 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  33.45 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  33.8 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  31.03 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  30.86 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  32.98 
 
 		 320 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  30.93 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  32.28 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  32.28 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  30.25 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  30.5 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  29.38 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  32.97 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  32.34 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  30.28 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  31.41 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  28.21 
 
 		 389 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  30.52 
 
 		 319 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.27 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  31.2 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  26.2 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1761  oxidoreductase  27.12 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  30.14 
 
 		 314 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  28.75 
 
 		 400 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1828  hypothetical protein  26.8 
 
 		 389 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.929329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  30.42 
 
 		 408 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  30.23 
 
 		 319 aa  99.8  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  28.9 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03498  oxidoreductase  27.33 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.906105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  31.61 
 
 		 412 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  30.59 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  24.36 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  24.04 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.73 
 
 		 807 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  27.51 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4035  PUA domain containing protein  28.57 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 		 776 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  32.37 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  39.87 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  24.04 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  24.04 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.54 
 
 		 768 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  24.04 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  24.04 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  24.04 
 
 		 399 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  24.04 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  26.47 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  27.09 
 
 		 392 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  29.43 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  34.38 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  26.28 
 
 		 396 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  23.72 
 
 		 399 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  28.06 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  31.88 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  26.96 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  31.88 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0364  hypothetical protein  28.05 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.953322 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  24.07 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  26.96 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  25.08 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  29.86 
 
 		 310 aa  91.7  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  25.08 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  23.28 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  26.49 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  26.96 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  30.9 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  26.98 
 
 		 391 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  26.96 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  27.21 
 
 		 493 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  27.3 
 
 		 701 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  26.96 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>