More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2397 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  627  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  69.21 
 
 		 303 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  69.67 
 
 		 305 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  69.33 
 
 		 305 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  69.33 
 
 		 305 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  69.77 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  69.33 
 
 		 305 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  69.67 
 
 		 302 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  68.21 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  69.54 
 
 		 302 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  67.33 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  67.67 
 
 		 303 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  67.67 
 
 		 303 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  66 
 
 		 303 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  68.26 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  56.6 
 
 		 319 aa  371  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  58.47 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  56.6 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  57.79 
 
 		 319 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  57 
 
 		 310 aa  359  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  51.19 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  50.52 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  50.17 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  52.6 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  52.4 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  50 
 
 		 320 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  47.81 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  48.79 
 
 		 313 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  50.87 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  50.52 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  47.42 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  50.17 
 
 		 318 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  49.48 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  41.78 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  46.15 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  42.91 
 
 		 299 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  42.42 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  40.48 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  38.93 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  32.01 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  34.2 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  31.34 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  33.58 
 
 		 338 aa  108  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  30.7 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  29.23 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  31.02 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  30.69 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  29.08 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  31.21 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  29.17 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  30.19 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  36.98 
 
 		 404 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  36.46 
 
 		 404 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  33.78 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  31.73 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.94 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  35.94 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  35.94 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  31.9 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  35.94 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.94 
 
 		 404 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  29.49 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  39.88 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  29.57 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  31.1 
 
 		 560 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  33.49 
 
 		 408 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 397 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  34.13 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  43.9 
 
 		 400 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 400 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.31 
 
 		 807 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  43.94 
 
 		 400 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  27.53 
 
 		 335 aa  95.5  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.34 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  29.46 
 
 		 397 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  27.72 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.07 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  28.3 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.26 
 
 		 713 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.26 
 
 		 713 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  34.38 
 
 		 422 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.45 
 
 		 699 aa  93.2  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  34.38 
 
 		 425 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  34.38 
 
 		 423 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  31.03 
 
 		 396 aa  93.2  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  42.42 
 
 		 400 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  92.8  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  42.11 
 
 		 397 aa  92.4  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  42.54 
 
 		 397 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.1 
 
 		 776 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  41.67 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.32 
 
 		 712 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>