More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3313 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  100 
 
 		 314 aa  652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  48.31 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  48 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  47.68 
 
 		 308 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  45.33 
 
 		 318 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  46.5 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  45.18 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  45.45 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  45.1 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  45.1 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  45.73 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  46.53 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  45.49 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  44.22 
 
 		 310 aa  269  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  44.79 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  45.86 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  43.21 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  42.86 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  43.16 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  43.75 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  42.51 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  43.1 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  43.6 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  43.25 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  40.62 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  41.03 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  40.42 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  41.78 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  41.11 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  40.07 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  36.75 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  38.51 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  36.96 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  40.55 
 
 		 305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  36.09 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  38.64 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  38.91 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  36.99 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  30.57 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  29.07 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  29.64 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  30.83 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  27.17 
 
 		 560 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.14 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.14 
 
 		 776 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  36.52 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.14 
 
 		 768 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  28.21 
 
 		 397 aa  95.9  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  31.52 
 
 		 400 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  35.36 
 
 		 380 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  30.42 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  36.02 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  29.03 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  29.2 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  29.2 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  31.77 
 
 		 397 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  35.91 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  32.14 
 
 		 397 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  31.15 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  28.45 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1191  oxidoreductase  31.34 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  36.11 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  36.54 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  31.58 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  31.87 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  33.57 
 
 		 400 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  32.87 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  30.1 
 
 		 404 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  28.7 
 
 		 400 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  30.1 
 
 		 404 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  30.1 
 
 		 404 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3540  hypothetical protein  30.28 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  30.04 
 
 		 415 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  28.7 
 
 		 400 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  27.27 
 
 		 390 aa  89.7  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  25.95 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  30.1 
 
 		 404 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  31.25 
 
 		 397 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0390  SAM-dependent methyltransferase  30.1 
 
 		 425 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  29.59 
 
 		 404 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  30.1 
 
 		 422 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  30.1 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2919  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0869648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  34.27 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3257  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  34.38 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0206  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0169  hypothetical protein  30.1 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3429  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  34.38 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  28.25 
 
 		 400 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.2 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2170  hypothetical protein  29.59 
 
 		 425 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  34.38 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  32.62 
 
 		 400 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  29.59 
 
 		 404 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  34.38 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  25.44 
 
 		 390 aa  86.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>