More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003801 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  100 
 
 		 310 aa  643    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  93.23 
 
 		 310 aa  607  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  63.44 
 
 		 321 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  60.52 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  60.54 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  60.54 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  61.87 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  58.58 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  59.28 
 
 		 308 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  58.25 
 
 		 313 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  55.99 
 
 		 320 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  59.03 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  56.31 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  58.25 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  50 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  48.84 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  47.87 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  49.3 
 
 		 303 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  48.17 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  47.84 
 
 		 305 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  48.01 
 
 		 305 aa  285  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  48.63 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  47.51 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  48.26 
 
 		 302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  47.18 
 
 		 303 aa  278  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  50.52 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  48.24 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  46.23 
 
 		 299 aa  275  7e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  48.01 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  47.68 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  44.22 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  45.3 
 
 		 319 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  44.3 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  45.52 
 
 		 302 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  47.7 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  44.71 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  40.74 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  42.53 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  34.13 
 
 		 338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  30.75 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 380 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  33.2 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  31.75 
 
 		 400 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  30.56 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  32.61 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  31.39 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  31.75 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.07 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  32.33 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  31.33 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  32.56 
 
 		 560 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  33.68 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  30 
 
 		 338 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  29.23 
 
 		 399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  34.9 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  28.87 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  28.87 
 
 		 399 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  30.53 
 
 		 338 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  31 
 
 		 363 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  30.7 
 
 		 335 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  29.23 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  29.86 
 
 		 479 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  32.45 
 
 		 408 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  32.04 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  29.77 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  27.22 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  32.69 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  34.9 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  29.45 
 
 		 396 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  32.64 
 
 		 396 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  32.64 
 
 		 396 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  29.45 
 
 		 396 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  32.64 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  32.64 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  32.64 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  32.64 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  32.64 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  29.37 
 
 		 400 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  34.39 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  28.71 
 
 		 409 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  37.42 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  29.76 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.77 
 
 		 807 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.61 
 
 		 711 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  30.61 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  32.12 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.17 
 
 		 712 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  29.67 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>