More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1661 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2094  hypothetical protein  98.43 
 
 		 319 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3357  hypothetical protein  71.88 
 
 		 319 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416158  normal  0.98402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2468  hypothetical protein  73.72 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.219028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  60.06 
 
 		 303 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  59.49 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  59.11 
 
 		 305 aa  384  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  59.42 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  58.54 
 
 		 305 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  58.23 
 
 		 305 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  58.47 
 
 		 305 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  59.74 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  59.42 
 
 		 308 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  57.83 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  56.87 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  55.59 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  56.23 
 
 		 303 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  53.67 
 
 		 302 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  56.6 
 
 		 305 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  59.26 
 
 		 305 aa  346  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  48.01 
 
 		 310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  48.89 
 
 		 313 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  48.87 
 
 		 313 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  45.9 
 
 		 310 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  45.6 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  46.5 
 
 		 318 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  46.18 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  46.79 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  44.34 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  46.33 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  46.89 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  43.89 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  41.38 
 
 		 321 aa  239  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  44.37 
 
 		 308 aa  236  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4405  hypothetical protein  37.46 
 
 		 299 aa  225  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.134753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.75 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  37.58 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  36.98 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  42.53 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  33.68 
 
 		 560 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  25.48 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  32.47 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  34.29 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  34.19 
 
 		 400 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  34.19 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  29.73 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  30.52 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  31.31 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  30.04 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  27.94 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2998  hypothetical protein  32.4 
 
 		 397 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.68 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.33 
 
 		 807 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  32.08 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  27.36 
 
 		 409 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  30.19 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  42.47 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  31.86 
 
 		 390 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  27.99 
 
 		 384 aa  95.5  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  29.59 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  26.77 
 
 		 395 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  35.6 
 
 		 402 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  27.05 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  31.78 
 
 		 395 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.04 
 
 		 768 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.42 
 
 		 776 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3712  SAM-dependent methyltransferase  29.68 
 
 		 393 aa  92.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  33.47 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  33.91 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  25.72 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  30.07 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  26.5 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  23.4 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  31.7 
 
 		 479 aa  89.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2168  PUA domain-containing protein  28.88 
 
 		 395 aa  89.4  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  29.26 
 
 		 390 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  26.91 
 
 		 335 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  25.95 
 
 		 390 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  29.26 
 
 		 390 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.1 
 
 		 711 aa  89  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  29.34 
 
 		 397 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  30.45 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  27.19 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  29.25 
 
 		 418 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.95 
 
 		 713 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.95 
 
 		 713 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  28.91 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.1 
 
 		 709 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  31.02 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  27.49 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  24.83 
 
 		 399 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.1 
 
 		 709 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  24.83 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  30.39 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  25.17 
 
 		 399 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.95 
 
 		 713 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  33.86 
 
 		 380 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>