More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2030 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  47.1 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.05 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.54 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  35.55 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.55 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  32.86 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  31.97 
 
 		 314 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  34.19 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  34.34 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  28.47 
 
 		 347 aa  82.4  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.62 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.34 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  26.8 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  31.6 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.89 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.87 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  28.67 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.41 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  25.25 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  28.92 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.51 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.95 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.3 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  31.51 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.08 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.64 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.17 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  28.62 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  29.71 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  33.18 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3008  hypothetical protein  31.62 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.645099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.71 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  25.61 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  30.51 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  35.36 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  31.56 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  27.68 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.37 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.78 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  22.54 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  27.55 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  25.78 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.78 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.47 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  25.78 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.63 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.78 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.81 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  28.65 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.78 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.47 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  29.14 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.17 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  22.09 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.06 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  24.17 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  25.94 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  32.68 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  31.19 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.96 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  32.76 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.18 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  30.17 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.3 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.95 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.59 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.54 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  21.35 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1625  hypothetical protein  30.65 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577522  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  26.64 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  28.65 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  21.35 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  26.37 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  24.44 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  25.65 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>