More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0090 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 
273 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  58.16 
 
 
287 aa  291  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  57.69 
 
 
294 aa  285  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  60.36 
 
 
282 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  59.64 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  57.88 
 
 
289 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  59.18 
 
 
334 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  59.63 
 
 
276 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  54.23 
 
 
296 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  52.8 
 
 
285 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0325  pantoate--beta-alanine ligase  57.81 
 
 
296 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  52.69 
 
 
288 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  58.43 
 
 
313 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  54.9 
 
 
314 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  58.43 
 
 
313 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  56.25 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  58.43 
 
 
313 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  53.53 
 
 
308 aa  258  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  55.96 
 
 
360 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  52.88 
 
 
303 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  55.69 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5364  pantoate--beta-alanine ligase  55.08 
 
 
311 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00859126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  56.16 
 
 
288 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  49.1 
 
 
283 aa  246  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  47.45 
 
 
289 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13634  pantoate--beta-alanine ligase  55.29 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.55171e-34  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.65 
 
 
283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  47.35 
 
 
279 aa  243  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
278 aa  239  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  46.38 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  58 
 
 
381 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  47.97 
 
 
281 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.89 
 
 
291 aa  237  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  48.91 
 
 
278 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3564  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  50.55 
 
 
283 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0144  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3469  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0142  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0136  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0137  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
283 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0126  pantoate--beta-alanine ligase  48.19 
 
 
283 aa  230  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  45.05 
 
 
273 aa  229  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.07 
 
 
282 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  44.69 
 
 
277 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  49.61 
 
 
283 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00132  pantoate-beta-alanine ligase  47.83 
 
 
283 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3526  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 
283 aa  228  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00131  hypothetical protein  47.83 
 
 
283 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  44.66 
 
 
282 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  42.81 
 
 
282 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  49.15 
 
 
304 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  49.63 
 
 
288 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1027  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
284 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  48.49 
 
 
301 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  50.51 
 
 
321 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  51.47 
 
 
283 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  48.76 
 
 
286 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  49.1 
 
 
287 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.32 
 
 
277 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  42.49 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  42.49 
 
 
283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 
282 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1702  pantoate--beta-alanine ligase  52.14 
 
 
283 aa  225  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.238045  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2423  pantoate--beta-alanine ligase  52.12 
 
 
283 aa  225  7e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  49.28 
 
 
296 aa  225  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2824  pantoate--beta-alanine ligase  48.01 
 
 
284 aa  225  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0816624  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0213  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 
284 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 
280 aa  224  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  47.27 
 
 
281 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.68 
 
 
280 aa  224  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 
284 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  51.34 
 
 
302 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  48.7 
 
 
283 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3119  pantoate--beta-alanine ligase  47.83 
 
 
284 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.620137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3063  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 
283 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.217741  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  51.52 
 
 
324 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
301 aa  223  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.19 
 
 
527 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2388  pantoate--beta-alanine ligase  50.94 
 
 
283 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0472601  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  47.12 
 
 
289 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4542  pantoate--beta-alanine ligase  51.8 
 
 
285 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246095  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0198  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 
284 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.518661  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  41.22 
 
 
282 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0197  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.742862  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  49.81 
 
 
289 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 
281 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  54.09 
 
 
618 aa  221  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0215  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0414083  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.35 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  47.64 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  49.26 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  43.32 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3992  pantoate--beta-alanine ligase  47.81 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  48.38 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>