More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2939 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  82.16 
 
 		 212 aa  347  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  78.5 
 
 		 213 aa  343  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  78.87 
 
 		 212 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  78.87 
 
 		 212 aa  332  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50.23 
 
 		 212 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  46.38 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  44.66 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  44.76 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  45.15 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  43.94 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  40.87 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  39.62 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  40 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  42.36 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.46 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  40.48 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.29 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.23 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  36.23 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  39 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  39.52 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  38.1 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  39.42 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  37.62 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  38.94 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.41 
 
 		 205 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  40.2 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  40.49 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  36.06 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  37.2 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  37.7 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  39.2 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  40.2 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  37.25 
 
 		 203 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  33.01 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.82 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  34.3 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  34.78 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  35.29 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  34.62 
 
 		 219 aa  121  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  33.01 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 		 203 aa  121  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.5 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.18 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.34 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  32.51 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.87 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.94 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  31.53 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1757  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  32.31 
 
 		 209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  32.24 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.84 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  27.49 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 		 215 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2461  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  27.55 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  33.67 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  34.6 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.08 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  28.65 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  27.7 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1800  threonine efflux protein, putative  28.64 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  31.8 
 
 		 228 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3581  lysine exporter protein LysE/YggA  31.32 
 
 		 222 aa  99.4  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00347  threonine efflux system  34.15 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29100  hypothetical protein  30.6 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0782  LysE family translocator protein  31.52 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.492943  normal  0.203666 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  28.77 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  32.51 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  32.57 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  32.51 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.96 
 
 		 210 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  32.57 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3452  LysE family translocator protein  29.51 
 
 		 204 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  32.57 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.18 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  33.17 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.23 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1462  lysine exporter protein LysE/YggA  31.96 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  32.5 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.86 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>