More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1348 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  100 
 
 		 391 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  54.85 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  52.55 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  53.73 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  48.74 
 
 		 404 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  49.23 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  53.04 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  53.06 
 
 		 365 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  50.64 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  46.8 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  47.48 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  47.49 
 
 		 408 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  48.14 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  48.08 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  46.68 
 
 		 410 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  48 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  48.16 
 
 		 409 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  47.57 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  45.37 
 
 		 436 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  44.81 
 
 		 459 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  46.26 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  43.9 
 
 		 419 aa  322  6e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  46.13 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  44.56 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  46.11 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  47.09 
 
 		 343 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  43.55 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  44.08 
 
 		 417 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  44.59 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  42.11 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  41 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  40.28 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  44.13 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  45.38 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  43.82 
 
 		 411 aa  289  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  40.92 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  41.38 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  39.39 
 
 		 434 aa  269  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  41.22 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  38.44 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  38.48 
 
 		 439 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  37.89 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  37.15 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  50.45 
 
 		 228 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  45.56 
 
 		 279 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  36.9 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  34.74 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  34.09 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  33.67 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  31.94 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  31.75 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  32 
 
 		 415 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  32.21 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  33.42 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  30.83 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  30.4 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  31.55 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  32.5 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  31.39 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  31.7 
 
 		 397 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  29.87 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  29.85 
 
 		 412 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  32.15 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  31.62 
 
 		 416 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  31.62 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  31.98 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  30.13 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  30.62 
 
 		 410 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  30.58 
 
 		 423 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  30.45 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  29.51 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  31.03 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  32.61 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 414 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  30.5 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  30.45 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  31.86 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  30.79 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.87 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 416 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  29.06 
 
 		 398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  29.09 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.61 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.61 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  27.14 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  30.03 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  32.02 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  30.88 
 
 		 425 aa  136  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  28.19 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  29.59 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  33.03 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  29.59 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  29.98 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  29.59 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  29.5 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0294  phage integrase  31.47 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  29.48 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.85 
 
 		 445 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>