293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2837 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
285 aa  597  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  73.33 
 
 
284 aa  447  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  73.33 
 
 
284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  50.55 
 
 
276 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2153  xylanase/chitin deacetylase  50.55 
 
 
276 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336279  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0156  polysaccharide deacetylase  44.64 
 
 
276 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0111  polysaccharide deacetylase family protein  43.38 
 
 
273 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565524  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  39.71 
 
 
273 aa  215  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  38.97 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  41.26 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  38.97 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  38.97 
 
 
273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  41.26 
 
 
273 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  41.26 
 
 
273 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  40.91 
 
 
273 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0476  NhaD  29.59 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.336062  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  30.63 
 
 
256 aa  142  7e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1105  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  32.55 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1658  polysaccharide deacetylase family protein  39.88 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0732576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  31.2 
 
 
278 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0570  polysaccharide deacetylase  38.41 
 
 
383 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0342536 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  28.17 
 
 
265 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  29.71 
 
 
373 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 
319 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 
298 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
272 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1976  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 
257 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1287  polysaccharide deacetylase  37.42 
 
 
366 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  normal  0.442268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.17 
 
 
279 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  30.87 
 
 
255 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
264 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.83 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 
234 aa  94  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1736  polysaccharide deacetylase  29.18 
 
 
249 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3300  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
327 aa  92.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.821044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  24.81 
 
 
373 aa  92.4  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  32.71 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  27.27 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4642  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
457 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.921462  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
548 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 
249 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
1015 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  32.99 
 
 
548 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  27.23 
 
 
306 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.24 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.56 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  29.44 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3105  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000266277  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  25.59 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 
371 aa  82.8  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1233  yggt family protein  23.51 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1932  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.656935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  28.73 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.56 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.91 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0290  polysaccharide deacetylase  25.16 
 
 
322 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.385946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 
347 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  22.34 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  27.17 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 
348 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  29.01 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  26.77 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  25.73 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  26.77 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  26.77 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0320  polysaccharide deacetylase family protein  28.63 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  24.8 
 
 
659 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.89 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  27.94 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  27.94 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
660 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  26.58 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  22.81 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  24.39 
 
 
659 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.04 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 
712 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.48 
 
 
386 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 
712 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2204  polysaccharide deacetylase  32.45 
 
 
402 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.61 
 
 
617 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  26.61 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.15 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  24.88 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  24.41 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  23.2 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>