189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2765 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1030  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  99.09 
 
 		 617 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2765  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  100 
 
 		 554 aa  1100    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0448  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  74.35 
 
 		 456 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2622  polysaccharide deacetylase family protein  99.64 
 
 		 279 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.424992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0150  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  99.28 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  55.37 
 
 		 437 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  55.37 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  55.37 
 
 		 274 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  55.37 
 
 		 274 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  54.27 
 
 		 310 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1448  polysaccharide deacetylase family protein  55.13 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3226  polysaccharide deacetylase family protein  54.7 
 
 		 437 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3111  polysaccharide deacetylase family protein  55.13 
 
 		 296 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  50.65 
 
 		 357 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  42.57 
 
 		 264 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  46.64 
 
 		 263 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  46.64 
 
 		 263 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  40.25 
 
 		 296 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  38.94 
 
 		 278 aa  180  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  38.94 
 
 		 256 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  36.93 
 
 		 262 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.87 
 
 		 258 aa  178  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  37.56 
 
 		 274 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  38.56 
 
 		 264 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  37.89 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 		 295 aa  171  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04002  Polysaccharide deacetylase family protein  29.46 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  32.91 
 
 		 321 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  26.67 
 
 		 306 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  26.15 
 
 		 306 aa  90.9  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  28.16 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1616  polysaccharide deacetylase  28.7 
 
 		 488 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  24.36 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  28.87 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4235  polysaccharide deacetylase  27.49 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  31.28 
 
 		 348 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0225  polysaccharide deacetylase family protein  26.73 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0136  polysaccharide deacetylase  30.54 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  29.72 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  30.81 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  25.71 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  28.17 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2837  polysaccharide deacetylase  27.04 
 
 		 285 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1249  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.651285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0340  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.15 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1796  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  28.76 
 
 		 348 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 354 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  22.55 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  30.7 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3249  polysaccharide deacetylase  30.62 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  26.94 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 659 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0811  Shf protein  25.64 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  26.29 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.71 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  23.17 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  21.61 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 1001 aa  67  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  25.88 
 
 		 660 aa  67  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0722  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 284 aa  66.6  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  24.19 
 
 		 320 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  27.31 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  25.52 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  30.37 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  29.91 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  21.61 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  27.31 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  26.51 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2104  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.71 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  27.31 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 628 aa  63.9  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  22.96 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  18.47 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  18.47 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  26.56 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  26.56 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.39 
 
 		 264 aa  63.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 		 353 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  20.45 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 		 1015 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  26.56 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.31 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2023  polysaccharide deacetylase  27.96 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.385946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>