157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3070 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3070  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 354 aa  709    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201984  normal  0.916822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2765  beta-Ig-H3/fasciclin  44.93 
 
 		 184 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  43.45 
 
 		 186 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0374  beta-Ig-H3/fasciclin  41.25 
 
 		 183 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5434  beta-Ig-H3/fasciclin  44.2 
 
 		 184 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14413  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5784  beta-Ig-H3/fasciclin  44.2 
 
 		 187 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.638561  hitchhiker  0.0026448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0459  hypothetical protein  39.31 
 
 		 185 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4248  beta-Ig-H3/fasciclin  43.07 
 
 		 183 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3054  secreted surface protein  43.28 
 
 		 189 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.272116 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  43.07 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  43.07 
 
 		 194 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  41.67 
 
 		 202 aa  112  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  40.25 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  40.25 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  42.75 
 
 		 186 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  39.19 
 
 		 185 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  41.22 
 
 		 184 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11878  Beta-Ig-H3/Fasciclin domain protein  41.61 
 
 		 193 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 		 184 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  41.73 
 
 		 195 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0997  beta-Ig-H3/fasciclin  39.63 
 
 		 184 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0074  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 184 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0260992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0221  beta-Ig-H3/fasciclin  41.01 
 
 		 191 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 185 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0089  beta-Ig-H3/fasciclin  35 
 
 		 184 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  38.96 
 
 		 164 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0973  beta-Ig-H3/fasciclin  35.57 
 
 		 202 aa  99.4  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.517899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3053  beta-Ig-H3/fasciclin  38.69 
 
 		 191 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.937158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  40.15 
 
 		 194 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1656  beta-Ig-H3/fasciclin  39.13 
 
 		 189 aa  97.1  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.29566  normal  0.495263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07881  hypothetical protein  39.04 
 
 		 210 aa  96.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  39.57 
 
 		 184 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  38.19 
 
 		 162 aa  95.9  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  38.69 
 
 		 193 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  37.41 
 
 		 192 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  38.41 
 
 		 187 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  39.52 
 
 		 238 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3782  beta-Ig-H3/fasciclin  35.76 
 
 		 183 aa  94  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.404689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  37.75 
 
 		 187 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  34.81 
 
 		 165 aa  93.2  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  37.67 
 
 		 167 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  39.72 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  34.25 
 
 		 166 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  37.66 
 
 		 166 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2243  beta-Ig-H3/fasciclin  38.06 
 
 		 187 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  36.99 
 
 		 160 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0910  beta-Ig-H3/fasciclin  35.42 
 
 		 208 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  37.58 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  34.72 
 
 		 222 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  36.03 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  37.31 
 
 		 134 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  38.82 
 
 		 596 aa  82.8  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.8 
 
 		 186 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  33.56 
 
 		 187 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  31.98 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2303  beta-Ig-H3/fasciclin  31.79 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00674889 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3054  beta-Ig-H3/fasciclin  35.09 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  33.99 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  31.82 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  33.55 
 
 		 178 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  35.95 
 
 		 161 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.29 
 
 		 141 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1192  beta-Ig-H3/fasciclin  33.56 
 
 		 140 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  35.82 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27077  predicted protein  37.5 
 
 		 143 aa  75.5  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.259215  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  33.79 
 
 		 163 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  36.99 
 
 		 157 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.75 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.53 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  34.27 
 
 		 133 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14646  predicted protein  34.46 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  33.56 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1202  beta-Ig-H3/fasciclin  30.43 
 
 		 272 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.27385  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 		 133 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5225  beta-Ig-H3/fasciclin  39.71 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0405  hypothetical protein  31.93 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0451  beta-Ig-H3/fasciclin  31.93 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.836003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  35.71 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.94 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  34.48 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  34.29 
 
 		 215 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  33.59 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  36.13 
 
 		 190 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  35 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10261  predicted protein  32.43 
 
 		 150 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00158824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1174  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1496  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.768836  normal  0.638636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3160  beta-Ig-H3/fasciclin  30.2 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  33.57 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  32.17 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  32.17 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0404  hypothetical protein  35.66 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000383864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3080  beta-Ig-H3/fasciclin  29.75 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000418721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  29.93 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  36.67 
 
 		 168 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54395  fasciclin domain-containing protein  29.38 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.190413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>