63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  100 
 
 		 340 aa  688    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  72.11 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  55.99 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.02 
 
 		 316 aa  355  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  53.02 
 
 		 316 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  53.02 
 
 		 316 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  53.29 
 
 		 580 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  52.7 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  52.23 
 
 		 314 aa  338  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.66 
 
 		 648 aa  332  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.68 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.23 
 
 		 315 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.58 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.1 
 
 		 505 aa  315  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  50.95 
 
 		 315 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  49.52 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.14 
 
 		 378 aa  291  7e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.83 
 
 		 378 aa  288  9e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  45.21 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.48 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.48 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  43.89 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  41.77 
 
 		 392 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  45.89 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.72 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.16 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.24 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.73 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.88 
 
 		 376 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.67 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  34.65 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  36.13 
 
 		 329 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.38 
 
 		 507 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.94 
 
 		 607 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.56 
 
 		 466 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  33.23 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.63 
 
 		 628 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.76 
 
 		 2073 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.2 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 634 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  32.24 
 
 		 627 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 634 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 634 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.03 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  28.97 
 
 		 502 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  30.43 
 
 		 1278 aa  89  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  27.51 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.77 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.61 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.75 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.95 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.85 
 
 		 334 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  23.7 
 
 		 699 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.38 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.2 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  23.88 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25.77 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  26.62 
 
 		 537 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>