More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_15330 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  47.41 
 
 		 274 aa  182  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  39.64 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.59 
 
 		 249 aa  118  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  29.73 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.78 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.49 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.99 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  31.82 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  30.56 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  26.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.13 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  26.96 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.6 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.71 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  32.53 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  30.9 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  27.94 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.6 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  31.95 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  29.68 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  24.07 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  28.94 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  29.95 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.38 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  31.72 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.22 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  33.48 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.77 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  28.78 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  33.86 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  25.53 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  24.51 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.47 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  28.87 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  26.81 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 276 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.29 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.95 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  29.81 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  29.1 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  24.78 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  33.83 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  28.27 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  24.89 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.83 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  28.63 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  27.62 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0024  phosphoribosyltransferase  23.86 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  30.9 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  29.17 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  30.36 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  30.67 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.91 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  40.83 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  39.32 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  33.19 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.33 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  38.52 
 
 		 255 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  29.03 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 		 242 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.22 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.45 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  40.2 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  29.29 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.53 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.45 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>