More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  100 
 
 		 188 aa  379  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  68.72 
 
 		 185 aa  255  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  52.33 
 
 		 189 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  36.9 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  38.65 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  37.74 
 
 		 176 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2368  Shikimate kinase  40.67 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  34.55 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  34.38 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  35.15 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  35.54 
 
 		 165 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  35.15 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  34.55 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  35.5 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  38.73 
 
 		 177 aa  99.8  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  35.12 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0013  shikimate kinase  34.93 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.668155  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  34.55 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  34.55 
 
 		 165 aa  98.6  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  34.55 
 
 		 170 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  40 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  32.94 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  34.55 
 
 		 165 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  31.74 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  34.71 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  37.72 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  36.36 
 
 		 167 aa  94.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  35.85 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1103  shikimate kinase  30.3 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.396409  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  40.28 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2413  shikimate kinase  37.74 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  33.93 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  36.48 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  36.59 
 
 		 170 aa  91.3  8e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0495  shikimate kinase  36.26 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  34.38 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  37.11 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  35.62 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6268  Shikimate kinase  36.84 
 
 		 170 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00441949  normal  0.76442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  37.25 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  33.92 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  33.53 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  35.47 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  38.04 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  32.77 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4347  shikimate kinase  34.62 
 
 		 156 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  36.25 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  38.56 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  35.85 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  29.76 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  36.21 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  34.64 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  36.25 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  35.22 
 
 		 170 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  37.96 
 
 		 495 aa  88.2  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  36.6 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  31.82 
 
 		 177 aa  87.8  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 167 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  37.01 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  34.66 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  35.06 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  37.01 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  29.76 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  34.73 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  36.25 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2617  Shikimate kinase  36.31 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  32.37 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  34.52 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  33.14 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  33.13 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  34.48 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  34.73 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  35.8 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  34.48 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  34.48 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  34.48 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  34.48 
 
 		 209 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  34.48 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  33.13 
 
 		 185 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  34.48 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2209  shikimate kinase  37.2 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218962  normal  0.751084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  34.48 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  37.06 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  34.57 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  33.53 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  33.13 
 
 		 170 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  35.54 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  35.54 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  35.63 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  36.67 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  30.23 
 
 		 189 aa  84.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  35.09 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  37.33 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  34.5 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0658  shikimate kinase  36.71 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07850  shikimate kinase  33.14 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0207717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  33.14 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  36.67 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1763  shikimate kinase  31.4 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1335  shikimate kinase  34.3 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.89172  normal  0.76234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>