More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07850 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07850  shikimate kinase  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0207717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  40.46 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01390  shikimate kinase  34.5 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  36.05 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  35.26 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3803  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00268813  normal  0.803666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03242  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00034661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03194  hypothetical protein  34.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000404125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3767  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3860  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0323  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000129228  normal  0.10404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3586  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.9305899999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3966  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.60057e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3883  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 173 aa  92  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0323  Shikimate kinase  34.88 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000263169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3666  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000538429  normal  0.0827574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4694  shikimate kinase I  34.88 
 
 		 225 aa  91.7  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000528588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3759  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00136839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3855  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000716125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3793  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3686  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3684  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000504262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0461  Shikimate kinase  30.36 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.196484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0472  shikimate kinase  35.33 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0810879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  34.3 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  35.93 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  35.93 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  32.53 
 
 		 173 aa  84.7  5e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  33.14 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  31.33 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4084  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000358948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4003  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000558194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  31.33 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4202  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4113  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0286  shikimate kinase I  34.13 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3698  shikimate kinase I  33.13 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000225658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0247  shikimate kinase I  33.13 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000294714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3894  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000513438  normal  0.331881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4265  shikimate kinase I  32.94 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00401521  normal  0.220429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  29.07 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  33.06 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0340  shikimate kinase I  33.92 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  32.35 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  31.03 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0260  Shikimate kinase  35.26 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0179047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  32.94 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  30.12 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  30.49 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0338  Shikimate kinase  34.68 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  30.12 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  31.43 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  31.43 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0238  shikimate kinase I  33.33 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000334252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  33.77 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  30.23 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  31.61 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0792  Shikimate kinase  33.05 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.5919e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0213  shikimate kinase I  32.93 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000106831  hitchhiker  0.00783685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  33.77 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  30.12 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  28.92 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  31.33 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0096  Shikimate kinase  32.34 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.650156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0692  shikimate kinase  31.97 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  27.22 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  34.76 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  30.3 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  27.82 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  33.33 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  28.66 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  33.13 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  32.73 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  29.07 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0611  shikimate kinase  33.05 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.78726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  34.68 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  30.71 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0008  shikimate kinase  35.77 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.780526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1113  shikimate kinase  30.52 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0015491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  28.31 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  29.81 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  34.67 
 
 		 552 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  35.25 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  28.92 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  29.07 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  33.82 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  30.14 
 
 		 495 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  31.14 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  28.38 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  31.47 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  33.33 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  28.14 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1230  shikimate kinase  29.27 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  33.13 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>