199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06580 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06580  predicted xylanase/chitin deacetylase  100 
 
 		 629 aa  1283    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4976  deacetylase  29.33 
 
 		 373 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.765353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2241  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 297 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.09 
 
 		 409 aa  89  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.09 
 
 		 409 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.09 
 
 		 409 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1014  polysaccharide deacetylase family protein  27.68 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3346  polysaccharide deacetylase family protein  27.68 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000257148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3475  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0138  polysaccharide deacetylase domain protein  24.38 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.2 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  24.15 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  24.15 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  24.15 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  26.78 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0678  polysaccharide deacetylase  25.66 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.945313  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3056  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  26.36 
 
 		 409 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  26.36 
 
 		 407 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  27.16 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  24.81 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  24.81 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  28.32 
 
 		 271 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1587  polysaccharide deacetylase  29.03 
 
 		 626 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0605374  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  27.43 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  26.23 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 1001 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 279 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  23.74 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  23.74 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 1015 aa  68.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.07 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 		 239 aa  67  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 278 aa  67  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  26.13 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0108  polysaccharide deacetylase  27.19 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2522  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 237 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.250856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  26.84 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  27.12 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  27.18 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1457  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  28.24 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.645637  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3089  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  26.46 
 
 		 273 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  26.46 
 
 		 273 aa  63.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0663  polysaccharide deacetylase family protein  24 
 
 		 261 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2676  polysaccharide deacetylase  27.5 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  25.68 
 
 		 273 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 		 264 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0181  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  23.58 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2752  polysaccharide deacetylase  25.43 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  27.4 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0091  xylanase/chitin deacetylase  26.41 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1402  xylanase/chitin deacetylase  25.93 
 
 		 256 aa  60.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0167631  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  25.21 
 
 		 354 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3615  polysaccharide deacetylase  24.22 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000857717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.88 
 
 		 348 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2084  polysaccharide deacetylase  27.85 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2320  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4190  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3801  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0260  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0504  hypothetical protein  27.97 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  26.82 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1121  polysaccharide deacetylase family protein  29.33 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0145  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  26.76 
 
 		 280 aa  57  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4122  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4321  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 348 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  43.28 
 
 		 503 aa  56.6  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 233 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  24.06 
 
 		 672 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  24.06 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  24.06 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  24.06 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  24.87 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  24.06 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0918  polysaccharide deacetylase  23.28 
 
 		 234 aa  55.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00302194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0653  regulatory protein, LacI  26.09 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.773413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  24.06 
 
 		 672 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3500  polysaccharide deacetylase family protein  25.44 
 
 		 349 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0046  polysaccharide deacetylase family protein  26.87 
 
 		 273 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0060  polysaccharide deacetylase family protein  26.87 
 
 		 273 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  24.06 
 
 		 672 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  38.46 
 
 		 929 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0161  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 342 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4855  polysaccharide deacetylase family protein  26.87 
 
 		 273 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0603  polysaccharide deacetylase  31.58 
 
 		 371 aa  55.1  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4000  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 348 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0336  polysaccharide deacetylase family protein  24.24 
 
 		 233 aa  55.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>