More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0290 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 757 aa  1552    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  43.68 
 
 		 766 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  41.45 
 
 		 748 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  39.51 
 
 		 778 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  37.31 
 
 		 772 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  36.82 
 
 		 772 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  37.48 
 
 		 759 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  35.25 
 
 		 827 aa  452  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  35.25 
 
 		 827 aa  452  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  35 
 
 		 890 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  35.51 
 
 		 881 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  36.39 
 
 		 774 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  38.51 
 
 		 776 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  37.33 
 
 		 777 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  36.03 
 
 		 773 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  38.24 
 
 		 780 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 773 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  35.8 
 
 		 773 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  37.17 
 
 		 775 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  35.22 
 
 		 773 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  37.17 
 
 		 774 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  36.28 
 
 		 742 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  35.62 
 
 		 773 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  37.27 
 
 		 836 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  35.47 
 
 		 774 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  34.78 
 
 		 768 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  36.25 
 
 		 833 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  35.8 
 
 		 824 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  35.8 
 
 		 826 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  35.14 
 
 		 790 aa  423  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  35.1 
 
 		 766 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  35.8 
 
 		 826 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  35.14 
 
 		 779 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  35.33 
 
 		 774 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  34.94 
 
 		 791 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  35.07 
 
 		 773 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  35.33 
 
 		 774 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  35.12 
 
 		 732 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  34.82 
 
 		 768 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  35.37 
 
 		 780 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  36.05 
 
 		 826 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  36.67 
 
 		 827 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  35.16 
 
 		 764 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  35.29 
 
 		 764 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  35.29 
 
 		 764 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 		 779 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  35.92 
 
 		 826 aa  415  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  35.25 
 
 		 777 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  34.75 
 
 		 781 aa  416  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 769 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  33.7 
 
 		 789 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  34.96 
 
 		 790 aa  403  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  35.02 
 
 		 830 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  34.47 
 
 		 796 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  33.75 
 
 		 790 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  33.81 
 
 		 787 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  39.37 
 
 		 662 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  33.47 
 
 		 791 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  35.7 
 
 		 840 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  35.09 
 
 		 841 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  35.7 
 
 		 840 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  35.56 
 
 		 840 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  35.7 
 
 		 840 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  34.95 
 
 		 754 aa  392  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  35.7 
 
 		 840 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  34.81 
 
 		 841 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  34.81 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  34.81 
 
 		 841 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  34.67 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  34.81 
 
 		 840 aa  385  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  34.67 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  34.67 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  34.67 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  35.1 
 
 		 814 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  34.67 
 
 		 844 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  38.55 
 
 		 701 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 667 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.41 
 
 		 648 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.55 
 
 		 744 aa  379  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  37.87 
 
 		 693 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 704 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 766 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  35.15 
 
 		 792 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  37.83 
 
 		 649 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 		 661 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 		 646 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.21 
 
 		 656 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  34.93 
 
 		 813 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.12 
 
 		 761 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 792 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.72 
 
 		 751 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  31.7 
 
 		 730 aa  357  5e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.34 
 
 		 806 aa  356  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 654 aa  347  7e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.98 
 
 		 641 aa  345  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.27 
 
 		 681 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.52 
 
 		 714 aa  340  7e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.84 
 
 		 714 aa  340  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.28 
 
 		 712 aa  339  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 		 643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>