56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1775 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  69.49 
 
 		 837 aa  1169    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  65.66 
 
 		 840 aa  1100    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  49.87 
 
 		 777 aa  711    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  69.67 
 
 		 858 aa  1169    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  69.67 
 
 		 858 aa  1169    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  69.18 
 
 		 858 aa  1161    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  53.57 
 
 		 808 aa  813    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  65.98 
 
 		 833 aa  1103    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  72.69 
 
 		 433 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  58.26 
 
 		 817 aa  938    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 820 aa  1687    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  70.17 
 
 		 838 aa  1145    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  70.17 
 
 		 838 aa  1162    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  55.71 
 
 		 803 aa  853    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  53.57 
 
 		 808 aa  813    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  69 
 
 		 847 aa  1159    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.86 
 
 		 860 aa  829    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  72.26 
 
 		 841 aa  1238    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.71 
 
 		 821 aa  857    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  65.12 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.64 
 
 		 715 aa  350  9e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.77 
 
 		 814 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.26 
 
 		 801 aa  329  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.83 
 
 		 692 aa  318  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.83 
 
 		 681 aa  319  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.61 
 
 		 802 aa  317  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.23 
 
 		 803 aa  316  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.61 
 
 		 800 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  31.47 
 
 		 881 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  31.09 
 
 		 881 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.09 
 
 		 882 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  30.97 
 
 		 882 aa  282  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  32.06 
 
 		 1160 aa  280  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.2 
 
 		 1592 aa  273  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.67 
 
 		 761 aa  267  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  28.63 
 
 		 835 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.19 
 
 		 1505 aa  252  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.38 
 
 		 798 aa  244  3.9999999999999997e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 1132 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.4 
 
 		 786 aa  221  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  28.4 
 
 		 786 aa  221  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  25.07 
 
 		 647 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  22.65 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  26.29 
 
 		 670 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  26.53 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  25.31 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  24.42 
 
 		 569 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  23.2 
 
 		 668 aa  55.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  26.91 
 
 		 644 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  23.4 
 
 		 650 aa  55.5  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  22.6 
 
 		 644 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.12 
 
 		 615 aa  53.5  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 		 663 aa  53.5  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  24.47 
 
 		 604 aa  48.5  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  27.49 
 
 		 621 aa  48.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  20.73 
 
 		 622 aa  45.8  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>