More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0098 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0098  PfkB  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00218841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0279  ribokinase-like domain-containing protein  72.14 
 
 		 283 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0275  PfkB domain protein  70.71 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0278  ribokinase-like domain-containing protein  71.07 
 
 		 283 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.365265  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0078  ribokinase-like domain-containing protein  71.12 
 
 		 286 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4458  carbohydrate kinase  70.25 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0267  ribokinase-like domain-containing protein  70.76 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3754  ribokinase-like domain-containing protein  70.4 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.415543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0268  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.25 
 
 		 279 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0271  ribokinase-like domain-containing protein  71.07 
 
 		 283 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0077  ribokinase-like domain-containing protein  72.14 
 
 		 281 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0383  ribokinase-like domain-containing protein  70.71 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4412  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  70.04 
 
 		 279 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.209851 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4799  ribokinase-like domain-containing protein  68.59 
 
 		 279 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4125  ribokinase-like domain-containing protein  62.5 
 
 		 280 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3518  carbohydrate kinase  63.48 
 
 		 292 aa  322  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0300  ribokinase family sugar kinase  24.83 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.750208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  23.08 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  23.08 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.61 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  25.09 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  23.4 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  25.56 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.45 
 
 		 424 aa  62.4  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  26.91 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  24.91 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  25.45 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.41 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  24.44 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  27.9 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1534  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.260714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1077  PfkB domain protein  28.91 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.679287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7070  PfkB domain protein  26.76 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  29.91 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  23.66 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  23.72 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  22.3 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  27.66 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23.65 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  27.06 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  24.75 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  25.94 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  22.89 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  24.32 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  25.94 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  26.32 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.53 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  20.41 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  26.69 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.32 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  27.66 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  25.43 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  24 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  25.66 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  25.86 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11351  putative pfkB family carbohydrate kinase  26.7 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  25.65 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.02 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  23.33 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  23.33 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  23.33 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  24.07 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  25.83 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  25.2 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.29 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  24.66 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  23.97 
 
 		 404 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  27.04 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  22.03 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  22.54 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  23.97 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  23.41 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  26.27 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  26.72 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  26.14 
 
 		 331 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  27.23 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  23.97 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  23.97 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.21 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  23.97 
 
 		 404 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75489  ribokinase  24.23 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.29059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  21.33 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  22.07 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  22.04 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.94 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  23.67 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>