More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4070 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  74.4 
 
 		 420 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  90.93 
 
 		 419 aa  796    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  90.17 
 
 		 422 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 439 aa  905    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  89.26 
 
 		 422 aa  783    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  65.79 
 
 		 420 aa  556  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  62.77 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  58.87 
 
 		 425 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  44.47 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  41.12 
 
 		 405 aa  290  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  41.52 
 
 		 404 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  39.04 
 
 		 432 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  42 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  37.83 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.25 
 
 		 415 aa  246  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  36.85 
 
 		 413 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  35.87 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  34.4 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  36.19 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  36.19 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  35.94 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  35.28 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.92 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  35.82 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.92 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  31.6 
 
 		 440 aa  186  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  32.91 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  32.28 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  33.65 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  31.63 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  28.78 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  32.92 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  32.51 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  30.33 
 
 		 411 aa  153  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  29.68 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  30.12 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  33.55 
 
 		 293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  29.29 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  29.79 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  31.82 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  28.26 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  31.05 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  29.56 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  28.3 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  31.13 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  29.63 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  28.93 
 
 		 426 aa  143  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  27.56 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  29.45 
 
 		 445 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  27.56 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  29.8 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  30.79 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  29.8 
 
 		 404 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  29.8 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  30.53 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.19 
 
 		 433 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  30.46 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  27.56 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  32.59 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  29.02 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  28.18 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  29.46 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 438 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  30.35 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  27.93 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  26.07 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  27.93 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  29.98 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  27.93 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  26.71 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.37 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1813  integrase family protein  31.64 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.471749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  29.48 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  28.16 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  30.63 
 
 		 396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.67 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  28.37 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  29 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  29.4 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  27.36 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  27.23 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  27.52 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 426 aa  133  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  28.89 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3563  integrase family protein  28.4 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1172  integrase family protein  28.4 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  28.28 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  30.81 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  28.76 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  27.18 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  28.46 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  28.88 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  27.55 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  28.33 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.53 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>