More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2999 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 419 aa  866    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  51.31 
 
 		 418 aa  464  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  52.34 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  30.21 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.2 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 419 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.95 
 
 		 380 aa  99.8  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  31.9 
 
 		 445 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.65 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  33.49 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  21.37 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  24.62 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.65 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  22.92 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.9 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.4 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.44 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.09 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.91 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>