More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0290 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  49.77 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  47.98 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  46.43 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  48.73 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  48.22 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  47.78 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  40.74 
 
 		 221 aa  177  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  46.27 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  44.34 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  46.77 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 		 209 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  42.79 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  43.96 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  45.64 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  44.17 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  45.73 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  43.54 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  44.83 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  43.84 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  42.11 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  47.06 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.16 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.27 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  43.35 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  41.35 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.78 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  42.64 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  39.34 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.28 
 
 		 204 aa  160  9e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  42.16 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  41.35 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  41.35 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.62 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  39.9 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  40.87 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  40.39 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  39.42 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 206 aa  157  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  44.1 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  40.85 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0196  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.371225 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0307  50S ribosomal protein L4P  43.23 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  38.84 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  40.58 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  38.84 
 
 		 235 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  39.22 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 212 aa  154  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  40.98 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  39.8 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  37.98 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  41.24 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  43.41 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  39.13 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  37.02 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  39.18 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  43.43 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  44.32 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  39.3 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  40.58 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 206 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  39.8 
 
 		 292 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  41.51 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  41.38 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  35.18 
 
 		 207 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  41.55 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0843  ribosomal protein L4/L1e  40.3 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>