More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1330 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
365 aa  735    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.95 
 
 
370 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.8 
 
 
379 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.22 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.32 
 
 
394 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 
374 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.65 
 
 
369 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.39 
 
 
372 aa  411  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.54 
 
 
372 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.08 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.84 
 
 
375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.27 
 
 
377 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.39 
 
 
372 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
379 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
380 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
380 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 
379 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  55 
 
 
376 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.48 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0820  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.66 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1187  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.5 
 
 
384 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00200873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.62 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 
379 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 
379 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
373 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.91 
 
 
367 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.67 
 
 
370 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2476  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.93 
 
 
383 aa  396  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
379 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
379 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
379 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 
373 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.25 
 
 
369 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.67 
 
 
395 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 
407 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 
379 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3755  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.29 
 
 
387 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.145582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.02 
 
 
386 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.53 
 
 
373 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.69 
 
 
370 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 
372 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.09 
 
 
380 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0455  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.43 
 
 
384 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 
382 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0983  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.95 
 
 
381 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.410572 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.23 
 
 
367 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.08 
 
 
375 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.76 
 
 
370 aa  385  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.51 
 
 
373 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0330  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.8 
 
 
388 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00349082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3305  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.14 
 
 
366 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.423867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.13 
 
 
372 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2795  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.42 
 
 
366 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2997  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 
384 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0919  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.81 
 
 
381 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
375 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0518  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 
405 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2456  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.72 
 
 
367 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.359127  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.82 
 
 
371 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
368 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1224  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
369 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.736515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.03 
 
 
355 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
368 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.01 
 
 
388 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  52 
 
 
394 aa  381  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1275  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.12 
 
 
336 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
377 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1231  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.69 
 
 
369 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.579512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.04 
 
 
381 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0396  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.01 
 
 
380 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000954967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.61 
 
 
377 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07170  tRNA-guanine transglycosylase  48.1 
 
 
382 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.934048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
369 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0712  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
377 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.3 
 
 
368 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.81 
 
 
384 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0964  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.18 
 
 
377 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0159  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
382 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.95405  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
392 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.12 
 
 
376 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.47 
 
 
367 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
392 aa  371  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02981  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
372 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.24 
 
 
377 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12610  tRNA-guanine transglycosylase  48.91 
 
 
382 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1785  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 
380 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0229472  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02931  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.77 
 
 
372 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03041  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.9 
 
 
372 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
374 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>