More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2394 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 367 aa  754    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.52 
 
 		 379 aa  411  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.7 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.82 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.02 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 		 372 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.08 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  57.34 
 
 		 371 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.91 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.87 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.93 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.18 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.76 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.97 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.09 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.56 
 
 		 380 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.31 
 
 		 376 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.81 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.25 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.87 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.26 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.73 
 
 		 375 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.11 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.8 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.73 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.46 
 
 		 377 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.6 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.37 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.39 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.99 
 
 		 397 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.3 
 
 		 369 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.73 
 
 		 374 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.57 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.63 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.57 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.83 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  54.55 
 
 		 371 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.12 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.11 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.54 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.74 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.79 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.23 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000052368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.68 
 
 		 370 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.44 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.26 
 
 		 374 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.44 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3520  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.47 
 
 		 377 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1241  normal  0.323798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.57 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000956702  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.72 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.71 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.4 
 
 		 374 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.79 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.27 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.08 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0863  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.18 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.94 
 
 		 369 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4621  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.35 
 
 		 377 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.559921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.83 
 
 		 388 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0876  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.23 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.97 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2547  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.52 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0677193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.78 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.94 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.89 
 
 		 447 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1156  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.09 
 
 		 388 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.26 
 
 		 385 aa  368  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.17 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.18 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.41 
 
 		 374 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.56 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.07 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.293358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.81 
 
 		 374 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.41 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.41 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.42 
 
 		 380 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>