More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0014 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  57.58 
 
 		 583 aa  684    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  89.21 
 
 		 593 aa  1052    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 595 aa  1208    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  48.43 
 
 		 541 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  49.45 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  48.01 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  48.27 
 
 		 588 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  43.81 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  42.91 
 
 		 515 aa  359  9e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  41.13 
 
 		 499 aa  343  5.999999999999999e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  40.64 
 
 		 509 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  38.73 
 
 		 654 aa  331  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  43.39 
 
 		 522 aa  317  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  36.82 
 
 		 549 aa  312  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  36.07 
 
 		 535 aa  294  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  34.26 
 
 		 606 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  33.04 
 
 		 575 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  38.1 
 
 		 493 aa  282  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  34.46 
 
 		 562 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  35.01 
 
 		 540 aa  278  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  34.26 
 
 		 543 aa  276  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  33.46 
 
 		 577 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0589  glycosidases-like  37.39 
 
 		 705 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.361866  normal  0.0110561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  38.81 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  39.57 
 
 		 537 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  34.13 
 
 		 591 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  33.4 
 
 		 682 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  36.85 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0601  alpha amylase catalytic region  32.6 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  36.65 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  36.85 
 
 		 572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22530  alpha amylase catalytic region  33.83 
 
 		 562 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  37.9 
 
 		 555 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  38.09 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  34.34 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  39.13 
 
 		 537 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  33.33 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0165  alpha amylase catalytic region  32.89 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000167663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  34.92 
 
 		 553 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2341  alpha amylase catalytic region  32.05 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  31.75 
 
 		 567 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2048  alpha amylase catalytic region  35.19 
 
 		 572 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  35.82 
 
 		 575 aa  262  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0417  oligo-1,6-glucosidase  32.44 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  33.15 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4167  alpha amylase catalytic region  35.49 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.718668  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1251  Alpha amylase, catalytic region  31.57 
 
 		 561 aa  261  3e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  33.6 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  33.58 
 
 		 585 aa  260  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  33.81 
 
 		 556 aa  260  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  34.3 
 
 		 1142 aa  260  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  33.52 
 
 		 553 aa  260  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0777  alpha amylase catalytic region  35.77 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.876516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0526  alpha amylase catalytic region  32.46 
 
 		 562 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  34.86 
 
 		 554 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0421  putative oligo-1,6-glucosidase  31.91 
 
 		 554 aa  258  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.591118  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  32.68 
 
 		 556 aa  258  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0354  alpha amylase catalytic region  31.34 
 
 		 554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  34.31 
 
 		 591 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  32.55 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5528  alpha amylase catalytic region  34.25 
 
 		 545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.283745  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  34.34 
 
 		 553 aa  255  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  33.08 
 
 		 1109 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  32.35 
 
 		 1100 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  34.89 
 
 		 554 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0307  alpha amylase catalytic subunit  35.45 
 
 		 525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  33.14 
 
 		 562 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  34.06 
 
 		 587 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  33.08 
 
 		 1101 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 553 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  33.21 
 
 		 1138 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  33.8 
 
 		 548 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  32.95 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  32.95 
 
 		 596 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  33.2 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  31.45 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4891  alpha amylase, catalytic region  33.87 
 
 		 538 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2519  alpha amylase  32.43 
 
 		 582 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  32.76 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  32.95 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  33.9 
 
 		 1099 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  33.52 
 
 		 1093 aa  250  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  34.29 
 
 		 524 aa  250  4e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  35.26 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  32.84 
 
 		 536 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  34.1 
 
 		 1100 aa  250  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  36.91 
 
 		 537 aa  250  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  34.05 
 
 		 567 aa  249  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  32.17 
 
 		 1115 aa  249  9e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1070  alpha-glucosidase  31.84 
 
 		 551 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  31.77 
 
 		 598 aa  249  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  33.02 
 
 		 1137 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  33.02 
 
 		 1137 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  33.02 
 
 		 1137 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5242  alpha amylase catalytic region  34.32 
 
 		 538 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  32.13 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  32.01 
 
 		 601 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  33.8 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2521  alpha amylase catalytic region  31.42 
 
 		 556 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2716  alpha amylase catalytic region  31.37 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0292835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>