More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4870 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 417 aa  839    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  76.98 
 
 		 424 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  61.78 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  65.09 
 
 		 422 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  46.46 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  45.73 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  45.73 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  43.16 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  45.48 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  42.05 
 
 		 412 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  42.09 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  43.29 
 
 		 429 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  41.41 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  41.39 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  43 
 
 		 416 aa  282  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  41.39 
 
 		 432 aa  282  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  39.1 
 
 		 394 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  37.5 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  40 
 
 		 413 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  39.37 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.73 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.13 
 
 		 372 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  30.83 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  29.6 
 
 		 376 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.29 
 
 		 358 aa  143  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.29 
 
 		 358 aa  143  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.14 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.13 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  28.64 
 
 		 376 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  30.26 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  30.26 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30.18 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  27.49 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  29.72 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  29.6 
 
 		 376 aa  133  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  28.31 
 
 		 372 aa  132  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  29.33 
 
 		 367 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.21 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  30.3 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  30.62 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  29.21 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  29.13 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  30 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  27.21 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  28.5 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  28.31 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  24.87 
 
 		 372 aa  120  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  29.17 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.93 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  27.65 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  29.01 
 
 		 383 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  29.56 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  28.53 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  30.73 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  27.25 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.42 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  28.46 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  26.02 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  30.18 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  30.71 
 
 		 389 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.77 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  29.62 
 
 		 381 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.13 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  25.85 
 
 		 424 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  27.76 
 
 		 385 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  27.81 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  28.61 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  28.61 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  29.59 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  30.49 
 
 		 401 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  28.07 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  28.2 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.31 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.54 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  26.28 
 
 		 385 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  28.35 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  26.68 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  27.09 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  34.5 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  29.51 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  27.09 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  25.68 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  31.22 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  25.6 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.71 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  25.93 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.17 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.39 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.25 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  24.93 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  24.16 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  26.75 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.89 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  24.07 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  26.26 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  26.67 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  25.2 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4448  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227619 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>