102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1022 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 411 aa  832    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  37.91 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  38.28 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  31.89 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  32.32 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  33.17 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  32.7 
 
 		 397 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  40.54 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  32.16 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  28.93 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  31.26 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  32.51 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  30.71 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  33.67 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  32.45 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  35.25 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  25.3 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.51 
 
 		 388 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  35.97 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  34.12 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  32.94 
 
 		 450 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.67 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  32.11 
 
 		 416 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  32.88 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  28.37 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  28.37 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  28.37 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  26.34 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  31.39 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  30.16 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  30.03 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  29.74 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  33.2 
 
 		 385 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  30.5 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  32.17 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  31.12 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  29.28 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  32.33 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  27.89 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  32.26 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  31.58 
 
 		 421 aa  110  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  31.52 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  26.05 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  26.05 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  29.65 
 
 		 380 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  27.52 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  29.34 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  28.71 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  31.08 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  29.69 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  30.08 
 
 		 430 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  31.34 
 
 		 435 aa  106  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  29.97 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  31.53 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  27.25 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  30.89 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  30.71 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  32.35 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  28.61 
 
 		 387 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  31.46 
 
 		 416 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.65 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  31.2 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  28.88 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  25.54 
 
 		 471 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  29.14 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  28.78 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  27.52 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  26.74 
 
 		 315 aa  93.6  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  28.16 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  27.05 
 
 		 562 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  30.77 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  25.94 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25.52 
 
 		 514 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  26.94 
 
 		 359 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  26.94 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  30.08 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  27.54 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.74 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.47 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  25.13 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  23.65 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  28.32 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  28.32 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  29.27 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  29.27 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.42 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  27.18 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  25.56 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  23.83 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  25.95 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.41 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.41 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  26.11 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  26.3 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  22.67 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  30.05 
 
 		 369 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  27.78 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  20.1 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  22.99 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  21.8 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>