93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1635 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 
393 aa  801    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  72.18 
 
 
405 aa  585  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  71.96 
 
 
398 aa  570  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  68.5 
 
 
387 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  65.33 
 
 
398 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  66.67 
 
 
387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  57.29 
 
 
388 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  44.81 
 
 
431 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  42.07 
 
 
403 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  45.36 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  45.08 
 
 
417 aa  305  7e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  46.88 
 
 
421 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  39.47 
 
 
435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  40.77 
 
 
428 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  42.63 
 
 
416 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  45.94 
 
 
421 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  46.56 
 
 
421 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  46.75 
 
 
420 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  42.07 
 
 
430 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  43.18 
 
 
417 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  44.27 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  44.27 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  41.67 
 
 
418 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  48.29 
 
 
380 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  43.98 
 
 
380 aa  269  5e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  40.81 
 
 
424 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  38.42 
 
 
407 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  42.77 
 
 
450 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  38.52 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  40 
 
 
388 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  37.43 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  37.78 
 
 
401 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  37.78 
 
 
401 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  37.43 
 
 
401 aa  234  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  35.06 
 
 
379 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  34.46 
 
 
379 aa  233  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  38.82 
 
 
425 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  35.34 
 
 
441 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  35.79 
 
 
416 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  34 
 
 
399 aa  211  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  32.03 
 
 
382 aa  204  2e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.26 
 
 
383 aa  199  7.999999999999999e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  32.56 
 
 
389 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  32.73 
 
 
389 aa  189  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  34.32 
 
 
382 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.89 
 
 
369 aa  181  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.05 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  30.92 
 
 
424 aa  164  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  34.34 
 
 
400 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  31.78 
 
 
382 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  31.78 
 
 
382 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  34.12 
 
 
399 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  30.59 
 
 
386 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  32.28 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  30.52 
 
 
420 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.3 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.97 
 
 
397 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.23 
 
 
385 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.53 
 
 
392 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  29.01 
 
 
405 aa  136  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  29.97 
 
 
385 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  29.97 
 
 
385 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.72 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  34.12 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.74 
 
 
312 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  27.46 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  27.84 
 
 
315 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.01 
 
 
413 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 
427 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.55 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.6 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  28.98 
 
 
562 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  26.16 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.41 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.18 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  24.41 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  23.55 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  27.35 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.76 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  22.76 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  21.57 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.67 
 
 
373 aa  59.7  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  26.9 
 
 
394 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  26.5 
 
 
479 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25.65 
 
 
514 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  25.48 
 
 
483 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.13 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.13 
 
 
396 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  24.18 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  23.78 
 
 
337 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>