37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2910 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 281 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 281 aa  554  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  97.52 
 
 		 282 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  65.82 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  28.42 
 
 		 409 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  27.24 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  26.52 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  28.32 
 
 		 411 aa  79  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  26.88 
 
 		 399 aa  72.4  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  26.37 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  26.57 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  25.55 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  26.6 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  26.6 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  26.6 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  26.17 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  24.83 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.7 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25.76 
 
 		 514 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  26.87 
 
 		 403 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  26.63 
 
 		 389 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  27.76 
 
 		 409 aa  53.1  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  32.2 
 
 		 781 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3579  phage major capsid protein, HK97  27.31 
 
 		 411 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.978109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.21 
 
 		 490 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  28.75 
 
 		 446 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  23.08 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  23.36 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  23.36 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  23.36 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3394  HK97 family phage major capsid protein  25.52 
 
 		 397 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000537798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  23.08 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  23.21 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.65 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  22.86 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  22.86 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  29.91 
 
 		 466 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>