98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1705 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  94.3 
 
 
421 aa  803    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  98.57 
 
 
421 aa  833    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 
421 aa  843    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  73.08 
 
 
430 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  63.24 
 
 
431 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  62.5 
 
 
417 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  61.24 
 
 
428 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  61.52 
 
 
417 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  59.43 
 
 
435 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  63.57 
 
 
418 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  62.44 
 
 
416 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  62.86 
 
 
417 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  60.49 
 
 
420 aa  481  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  60.72 
 
 
424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  56.47 
 
 
403 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  58.12 
 
 
408 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  46.37 
 
 
471 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  46.1 
 
 
419 aa  350  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  44.42 
 
 
407 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  43.28 
 
 
406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  46.48 
 
 
405 aa  326  5e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  48.7 
 
 
380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  44.36 
 
 
401 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  44.36 
 
 
401 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  44.36 
 
 
401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  44.56 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  40.57 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  41.49 
 
 
441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  41.84 
 
 
388 aa  302  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  40.75 
 
 
425 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  46.88 
 
 
393 aa  295  9e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  40.38 
 
 
416 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  46.42 
 
 
387 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  43.85 
 
 
387 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  46.42 
 
 
398 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  41.85 
 
 
450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  37.25 
 
 
399 aa  257  3e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  36.31 
 
 
388 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  36.81 
 
 
379 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  33.25 
 
 
379 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  34.83 
 
 
389 aa  209  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  30.62 
 
 
382 aa  204  3e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  34.83 
 
 
382 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.71 
 
 
424 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  34.93 
 
 
389 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.11 
 
 
383 aa  195  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.8 
 
 
403 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.47 
 
 
369 aa  180  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  31.69 
 
 
382 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  31.69 
 
 
382 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 
384 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  35.57 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  31.95 
 
 
400 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  32.65 
 
 
385 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.25 
 
 
385 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.25 
 
 
385 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  32.34 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  31.67 
 
 
397 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  32.18 
 
 
385 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  32.94 
 
 
420 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  30.63 
 
 
390 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  32.74 
 
 
399 aa  153  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.22 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.25 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  32.33 
 
 
411 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.89 
 
 
388 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  25.41 
 
 
386 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  31.44 
 
 
400 aa  99.8  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.18 
 
 
413 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  26.79 
 
 
562 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  23.12 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  23.12 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  23.12 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.25 
 
 
417 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  24.91 
 
 
315 aa  84  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  29.08 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  27.71 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  24.14 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  24.18 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  28.57 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  25.19 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  24.55 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  23.57 
 
 
440 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  26.95 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  27.91 
 
 
479 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  23.9 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  23.33 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  23.6 
 
 
514 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  21.61 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  21.98 
 
 
346 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  25.33 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  24.4 
 
 
434 aa  47  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  27.32 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  20.8 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  20.53 
 
 
391 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  20.8 
 
 
396 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  24.33 
 
 
483 aa  43.5  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>