114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0852 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 386 aa  788    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  68.3 
 
 		 388 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  36.57 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  36.57 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  35.71 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  35.07 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  33.76 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  32.64 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  30.7 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.7 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  25.3 
 
 		 411 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  30.16 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  28.7 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  29.84 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  29.84 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  27.06 
 
 		 385 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  31.66 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  28.05 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  27.74 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  28.8 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  28.05 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  28.05 
 
 		 385 aa  119  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  28.16 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  24.86 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  28.35 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  29.12 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  27.57 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  26 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  25.59 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  27.85 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  28.47 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  27.04 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  28.36 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  27.08 
 
 		 403 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  30.29 
 
 		 441 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  24.33 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  26.76 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  28.42 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.42 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  25.19 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  26.72 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  27.67 
 
 		 431 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  28.12 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  28.89 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  24.71 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  27.85 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  27.46 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  26.46 
 
 		 421 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  25.36 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  25.74 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  26.14 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  26.13 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  26.13 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  28.18 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  26.13 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  26.96 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  27.44 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  25.41 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  27.23 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.33 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  24.66 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  27.67 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  27.86 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  24.93 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  26.96 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  28.97 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  28.97 
 
 		 379 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  25.27 
 
 		 421 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  25.24 
 
 		 380 aa  93.2  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  27.97 
 
 		 466 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  28.52 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  21.55 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  24.2 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  23.77 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  26.57 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  24.33 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  22.8 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  25.67 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  23.45 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  26.65 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  26.65 
 
 		 437 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  22.76 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  26.02 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  25.76 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  22.88 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.79 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.79 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  22.38 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2593  HK97 family phage major capsid protein  24.48 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.74 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  25.75 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  26.07 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2624  phage major capsid protein, HK97 family  24.86 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  23.21 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  23.1 
 
 		 368 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  23.56 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  22.3 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  24.28 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  22.53 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  24.15 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>