122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0337 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 382 aa  776    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 382 aa  776    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  76.36 
 
 		 384 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  54.45 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  50.15 
 
 		 389 aa  357  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  50 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  50 
 
 		 385 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  51.04 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  45.87 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  44.42 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  44.47 
 
 		 385 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  47.04 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  45.54 
 
 		 420 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  38.71 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  36.24 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  36.15 
 
 		 428 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  38.73 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  35.55 
 
 		 435 aa  200  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  34.43 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  33.24 
 
 		 407 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  33.84 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  33.42 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  35.09 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  37.87 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  33.69 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  34.36 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  36.79 
 
 		 380 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  34.09 
 
 		 431 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  35.29 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  33.06 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  34.26 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  33.51 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  34.89 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  34.89 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  33.06 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  31.17 
 
 		 421 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  35.44 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  32.81 
 
 		 399 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  31.69 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  34.32 
 
 		 417 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  32.63 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  32.1 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  32.1 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  33.72 
 
 		 388 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  30.26 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  33.05 
 
 		 430 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  31.95 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  31.73 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  31.27 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  33.94 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  33.85 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.85 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  31.22 
 
 		 379 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  31.22 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  31.78 
 
 		 393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  29.79 
 
 		 399 aa  156  6e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  26.63 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  28.36 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  25.85 
 
 		 383 aa  152  7e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  29.33 
 
 		 392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  29.62 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  30 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  29.84 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  27.38 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28.36 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  26.92 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  26.05 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  32.05 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  28.75 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  26.49 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  26.49 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  26.49 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  29.32 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.25 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  28.46 
 
 		 315 aa  90.1  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.98 
 
 		 425 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  29.15 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  29.52 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  26.14 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.13 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.81 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  27.55 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.19 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.91 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.7 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.7 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.8 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  22.48 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  25.22 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  23.28 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  22.03 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  21.74 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  25.58 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  25.63 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  25.63 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4311  phage major capsid protein, HK97  25.63 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101318  normal  0.740598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  23.17 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  24.66 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>