88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4253 on replicon NC_014149
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 440 aa  911    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  32.44 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  30.77 
 
 		 413 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  32.32 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  30.61 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.06 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  28.93 
 
 		 425 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  30.33 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.64 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.45 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  28.24 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.01 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  27.59 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  33.43 
 
 		 373 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  30.38 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.89 
 
 		 403 aa  97.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  23.99 
 
 		 450 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  28.28 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  29.32 
 
 		 382 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  29.32 
 
 		 382 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  28.69 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.55 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  24.26 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  26.33 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  23.92 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  22.8 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  29.05 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  28.24 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  32.3 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  26.15 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  26.19 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  25.58 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  25.91 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  26.25 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  24.63 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  25.93 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  24.9 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  26.14 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.61 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  25.23 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  26.86 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  25.21 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  25 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  25.35 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  25.21 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  26.5 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  22.6 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  26.51 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  26.29 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  26.21 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  25.78 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  25.7 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  23.57 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  26.1 
 
 		 408 aa  63.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  23.89 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  34.48 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  21.76 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  24.26 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  24.52 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.26 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  22.74 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.56 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  24.74 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  27.63 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  27.63 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  27.63 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  24.64 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  22.9 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  28.85 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  23.39 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  21.39 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  20.88 
 
 		 380 aa  53.9  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  23.53 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  26.95 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  26.95 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  23.84 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  22.27 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2169  major capsid protein HK97  24.61 
 
 		 320 aa  50.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  23.86 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  24.89 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  24.89 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  20.96 
 
 		 369 aa  47  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  20.4 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  28.57 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  28.57 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  28.57 
 
 		 645 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.83 
 
 		 389 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>