102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0951 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 389 aa  794    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  35.07 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  36.25 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  36.95 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  35.32 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  36.43 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  39.52 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  35.68 
 
 		 428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  35.52 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  34.83 
 
 		 421 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  34.55 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  30.87 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  36.54 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  38.51 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  36.31 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  34.83 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  33.9 
 
 		 430 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  34.12 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  36.74 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  35.46 
 
 		 418 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  34.57 
 
 		 417 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  35.48 
 
 		 388 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  29.82 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  35.81 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  35.57 
 
 		 398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  33.88 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  33.87 
 
 		 435 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  34.55 
 
 		 450 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  34.75 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  32.56 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  32.47 
 
 		 419 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  34.38 
 
 		 417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  35.01 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  34.25 
 
 		 387 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  27.52 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.25 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  29.61 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  31.37 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  33.98 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  33.98 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.16 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  30.68 
 
 		 399 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.36 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  30.36 
 
 		 397 aa  156  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  28.82 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.17 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.95 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  29.56 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  28.22 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  27.86 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  28.24 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  25.34 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  28.57 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  28.57 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  29.78 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  29.21 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  27.78 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  27.7 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  29.29 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  27.88 
 
 		 388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  26.85 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  28.67 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  27.57 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  26.34 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.32 
 
 		 390 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  28.87 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  28.87 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  33.98 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  32.31 
 
 		 427 aa  95.9  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  32.31 
 
 		 427 aa  95.9  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  32.31 
 
 		 427 aa  95.9  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.75 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  23.93 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  24.93 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  21.43 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  24.61 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  23.61 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  24.23 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  23.39 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  22.39 
 
 		 483 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  24.54 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  22.35 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  20.79 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  24.93 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  20.79 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  44.12 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  23.38 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  24.88 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  21.63 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  23.45 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  23.33 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  21.86 
 
 		 437 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  24.02 
 
 		 368 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  23.29 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.91 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.91 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.14 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  23.03 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>