43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1719 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 429 aa  884    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  52.74 
 
 		 337 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  35.55 
 
 		 483 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  32.17 
 
 		 434 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  34.71 
 
 		 466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  34.29 
 
 		 423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  32.63 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  34.01 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.29 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  26.34 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  25.94 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  25.09 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  23.01 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  24.5 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  24.14 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.33 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  24.5 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  24.04 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  22.48 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  22.48 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  24.44 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  24.25 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  24.31 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  23.19 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  21.99 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  24.28 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1305  hypothetical protein  19.17 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.81 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  37.36 
 
 		 624 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  37.36 
 
 		 624 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  24.48 
 
 		 315 aa  53.9  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  22.36 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  22.36 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  35.16 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  35.16 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  25.97 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.75 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  20.65 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.75 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  21.45 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0012  phage major capsid protein, HK97 family  49.02 
 
 		 404 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  21.32 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  20.65 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>