40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2848 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  93.62 
 
 		 423 aa  815    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 437 aa  904    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  94.05 
 
 		 437 aa  845    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  35.45 
 
 		 466 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  34.93 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  32.63 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  27.54 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  26.37 
 
 		 438 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  27.34 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  22.5 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25.9 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  26.02 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  29.82 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  27.41 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  22.33 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  22.57 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  22.77 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  23.83 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  23.31 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  23.92 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  21.63 
 
 		 389 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.93 
 
 		 392 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  24.37 
 
 		 315 aa  50.1  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  20.1 
 
 		 411 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  23.86 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  22.89 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  23.23 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  24.05 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  21.82 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  21.82 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  21.82 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  21.74 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  25.86 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  25.86 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  21.97 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  24.43 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  23.5 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  23.5 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  20.8 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  25.4 
 
 		 562 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>