88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1998 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 438 aa  885    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  30.53 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  31.46 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2866  phage major capsid protein, HK97  26.95 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  25.29 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1985  phage major capsid protein, HK97  29.8 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2848  phage major capsid protein, HK97  26.37 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  25.78 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  26.01 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  23.81 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  25.6 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  26.75 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  26.56 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  22.73 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  26.48 
 
 		 403 aa  90.1  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  23.75 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  21.55 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  25.47 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  27.07 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  25.24 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  28.32 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  24.75 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  26.94 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  21.31 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  24.04 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  23.85 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  25.78 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  25.78 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  25.78 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  26.95 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  24.37 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  25.91 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  25.91 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  25.91 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  26.81 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  26.95 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  25.86 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  24.04 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.51 
 
 		 490 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  26.5 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  23.56 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  25.73 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  22.86 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  25.87 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  23.13 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  23.13 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  22.27 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  22.27 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  26.62 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  24.4 
 
 		 312 aa  54.7  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  25.85 
 
 		 407 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  23.45 
 
 		 403 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  21.52 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  21.94 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  24.48 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  22.42 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  23.91 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  21.23 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  24.04 
 
 		 646 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  23.29 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  23.11 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  27.04 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  22.14 
 
 		 416 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  25.68 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  23.84 
 
 		 645 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  23.84 
 
 		 645 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  23.84 
 
 		 645 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  26.14 
 
 		 386 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  25.59 
 
 		 398 aa  50.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  24.07 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  23.49 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  23.23 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  24.94 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  23.29 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  23.83 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  23.08 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0362  HK97 family phage major capsid protein  25.73 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0991  HK97 family phage major capsid protein  25.73 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  22.84 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  22.62 
 
 		 624 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  20.45 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  23.77 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  25 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.88 
 
 		 279 aa  43.9  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3892  hypothetical protein  31.25 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0353742 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  22.17 
 
 		 624 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  22.17 
 
 		 624 aa  43.5  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>