110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1359 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 385 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  77.28 
 
 		 385 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  57.58 
 
 		 390 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  58.42 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  58.42 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  53.42 
 
 		 386 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  46.22 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  47.2 
 
 		 382 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  47.31 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  44.47 
 
 		 382 aa  298  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  44.47 
 
 		 382 aa  298  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  43.72 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  46.65 
 
 		 420 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  43.05 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  35.06 
 
 		 435 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  35.47 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  33.76 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  35.18 
 
 		 450 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  36.42 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  35.28 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  33.68 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  32.83 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  35.04 
 
 		 380 aa  176  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  35.24 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  31.3 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  34.16 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  35.71 
 
 		 431 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  34.43 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  32.65 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  34.29 
 
 		 417 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  34.13 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  29.78 
 
 		 401 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  33.79 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  32.39 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  30.75 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  33.03 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  31.62 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  32.33 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  34.2 
 
 		 405 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  34.57 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  30.49 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  31.37 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  35.47 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  33.6 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  32.61 
 
 		 430 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  32.29 
 
 		 417 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  33.94 
 
 		 387 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.94 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  34.55 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  29.11 
 
 		 405 aa  153  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  32.67 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  34.1 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  29.9 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  28.24 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  26.19 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  32.29 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.65 
 
 		 392 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  27.39 
 
 		 399 aa  138  1e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  31.81 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  27.86 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  27.06 
 
 		 386 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  26.96 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  28.16 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  29.9 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  29.9 
 
 		 379 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  33.2 
 
 		 411 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  29.3 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  30.96 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  31.62 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  32.02 
 
 		 312 aa  93.2  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  24.86 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  24.86 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  24.86 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  26 
 
 		 315 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  27.83 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  28.69 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  27.93 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.15 
 
 		 400 aa  82.8  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  28.09 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  27.07 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.84 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.2 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  26.74 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  24.14 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  25.44 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  24.04 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  26.96 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  26.96 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  26.96 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  25.98 
 
 		 506 aa  56.2  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  26.62 
 
 		 624 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  28.69 
 
 		 446 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  23.86 
 
 		 466 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.74 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  25.74 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  25.2 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  23.55 
 
 		 483 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3805  phage major capsid protein, HK97  25.42 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3878  phage major capsid protein, HK97  25.42 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>