106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0277 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 385 aa  783    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  77.28 
 
 		 385 aa  624  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  59.58 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  59.58 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  60.22 
 
 		 390 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  54.45 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  44.47 
 
 		 403 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  45.87 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  45.87 
 
 		 382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  44.95 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  45.19 
 
 		 384 aa  300  4e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  46.41 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  42.47 
 
 		 420 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  38.52 
 
 		 424 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  33.93 
 
 		 435 aa  186  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  31.36 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  31.22 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  34.39 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  30.59 
 
 		 425 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  30.56 
 
 		 407 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  33.6 
 
 		 428 aa  166  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  30.96 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  30.43 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  32.57 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  32.86 
 
 		 418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  32.4 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  33.14 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  34.94 
 
 		 380 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  29.97 
 
 		 420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  33.71 
 
 		 421 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  29.14 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  31.63 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  33.25 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  32.18 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  31.33 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  31.32 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  33.14 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  32.63 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  30.41 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  31.46 
 
 		 408 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  32.18 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  30.66 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  33.14 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.14 
 
 		 398 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  28.29 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  32.4 
 
 		 388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  30.06 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  32.18 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  26.98 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  29.04 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  29.04 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  29.78 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  31.37 
 
 		 416 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  30.23 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  30.77 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  27.51 
 
 		 399 aa  132  6.999999999999999e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  29.72 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  30.95 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.9 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  27.78 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  25 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  24.86 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  31.12 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.51 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  27.33 
 
 		 379 aa  109  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  27.85 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  25.27 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  27.87 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.36 
 
 		 312 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  27.93 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.48 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  27.15 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  23.64 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  23.64 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  23.64 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  25.47 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  22.74 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  25.91 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  26.94 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  25.99 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  26.52 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  26 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.66 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  26.52 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1719  HK97 family phage major capsid protein  24.31 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  25.34 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  25.34 
 
 		 624 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  25.34 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  23.93 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  25.6 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  25.15 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  20.4 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  20.4 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  23.35 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2469  hypothetical protein  62.16 
 
 		 108 aa  50.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2592  phage major capsid protein, HK97 family  26.85 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  22.83 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.58 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  22.92 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>