91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1542 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 419 aa  861    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  57.11 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  50.61 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  49.11 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  49.75 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  50.9 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  48.05 
 
 		 431 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  46.65 
 
 		 428 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  49.09 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  46.35 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  49.09 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  46.1 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  47.1 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  46.1 
 
 		 421 aa  333  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  44.82 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  44 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  44.16 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  46.91 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  44.9 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  43.25 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  43.26 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  46.72 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  43.03 
 
 		 416 aa  299  7e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  40.89 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  40.41 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  40.66 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  41.13 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  38.6 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  40.52 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  35.75 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  38.44 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  37.43 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  39.24 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  40.52 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  40.52 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  38.24 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  31.65 
 
 		 399 aa  196  8.000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  37.59 
 
 		 388 aa  190  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  34.04 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  33.77 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  32.47 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  37.54 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  31.55 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  33.06 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  33.06 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  28.42 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.01 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  31.55 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  25.39 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.55 
 
 		 385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  34.87 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  28.47 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  30.41 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  35.36 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  35 
 
 		 397 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  35.63 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  35.63 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  36.71 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  32.61 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  31.99 
 
 		 399 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  29.72 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  31.86 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  30.79 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.92 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  26.9 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  25.72 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  25.13 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  27.8 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  24.26 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  25.67 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  29.51 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  23.35 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  23.35 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  23.35 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  28.38 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  27.39 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  25.26 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  22.34 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  24.34 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  23.02 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  24.54 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.09 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  23.26 
 
 		 394 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  27.91 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  24.07 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  24.34 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.43 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  24.88 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  26.76 
 
 		 490 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  20.29 
 
 		 359 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>