93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0867 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 		 407 aa  833    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  80.54 
 
 		 406 aa  689    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  51.85 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  51.85 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  51.36 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  48.03 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  52.8 
 
 		 380 aa  345  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  44.42 
 
 		 421 aa  338  8e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  47.46 
 
 		 408 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  48.22 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  42.86 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  43.67 
 
 		 421 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  43.84 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  46.06 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  45.43 
 
 		 416 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  45.5 
 
 		 380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  43.81 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  45.45 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  44.17 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  46.35 
 
 		 428 aa  322  5e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  43.32 
 
 		 430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  44.7 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  44.64 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  43.94 
 
 		 418 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  43.26 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  43.8 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  41.23 
 
 		 416 aa  292  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  44.53 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  41.99 
 
 		 405 aa  262  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  40.77 
 
 		 450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  37.89 
 
 		 388 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  38.46 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  38.6 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  37.99 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  40.3 
 
 		 387 aa  239  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  35.07 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  40.06 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  39.76 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  36.39 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  31.74 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  35.62 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  31.36 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  35.4 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  30.94 
 
 		 383 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  33.24 
 
 		 382 aa  196  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  33.24 
 
 		 382 aa  196  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.95 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  34.81 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 		 379 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.27 
 
 		 424 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  33.07 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  32.83 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  31.95 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.37 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  29.95 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  31.92 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  31.92 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.65 
 
 		 369 aa  168  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  30.75 
 
 		 399 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.56 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  32.41 
 
 		 420 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  29.41 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  26.93 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.57 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  31.39 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  29.26 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  27.57 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  31.28 
 
 		 312 aa  97.1  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  27.52 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  25.32 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  25.32 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  25.32 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.94 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.76 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  23.45 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  29.1 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  20.81 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  22.83 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  24.02 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  23.06 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.06 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  24.65 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  21 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  28.32 
 
 		 279 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.82 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  28.85 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  23.74 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.85 
 
 		 438 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  21.32 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  23.35 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  33.67 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  30.65 
 
 		 506 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  23.79 
 
 		 389 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>