92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6186 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  100 
 
 		 471 aa  957    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  57.11 
 
 		 419 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  50.25 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  46.85 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  45.59 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  44.78 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  45.61 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  46.37 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  45.86 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  46.52 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  44.58 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  46.27 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  44.72 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  45.75 
 
 		 420 aa  349  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  46.1 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  42.86 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  43.81 
 
 		 403 aa  329  8e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  42.93 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  46.78 
 
 		 416 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  41.79 
 
 		 441 aa  323  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  43.32 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  41.35 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  44.42 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  40.94 
 
 		 401 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  40.1 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  40.39 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  43.29 
 
 		 405 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  38.81 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  41.3 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  41.77 
 
 		 388 aa  274  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  41.3 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  38.7 
 
 		 380 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  44.24 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  44.27 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  40.42 
 
 		 380 aa  269  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  38.94 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  35.85 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  38.33 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  32.34 
 
 		 382 aa  209  7e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  36.18 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  34.79 
 
 		 403 aa  204  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  38.51 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  34.94 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  34.76 
 
 		 379 aa  196  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  33.08 
 
 		 382 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.78 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.75 
 
 		 369 aa  182  8.000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  30.26 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  30.26 
 
 		 382 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  31.62 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  30.65 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  34.16 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  35.22 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  34.67 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.41 
 
 		 385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  29.26 
 
 		 424 aa  156  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  34.67 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  31.82 
 
 		 385 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  31.82 
 
 		 385 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  32.62 
 
 		 386 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  35.31 
 
 		 392 aa  147  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.86 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  28.91 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  29.78 
 
 		 420 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  28.35 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  27.3 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  25.39 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  25.54 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  25.54 
 
 		 411 aa  96.7  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  29 
 
 		 312 aa  96.3  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  24.54 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  30.03 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  27.27 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  22.77 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  22.77 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  22.77 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.39 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  26.3 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  27.1 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  21.53 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  24.81 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  25.78 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.86 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  25.1 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.04 
 
 		 359 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  24.76 
 
 		 346 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  23.22 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  22.51 
 
 		 409 aa  53.5  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  25.11 
 
 		 279 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.95 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  24.19 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2624  phage major capsid protein, HK97 family  41.67 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>