97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1047 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  85.61 
 
 
425 aa  755    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  100 
 
 
441 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  65.05 
 
 
416 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  43.81 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  41.67 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  41.79 
 
 
471 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  44 
 
 
419 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  44.97 
 
 
418 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  46.02 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  45.05 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  41.77 
 
 
430 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  44.47 
 
 
416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  42.14 
 
 
417 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  43.25 
 
 
417 aa  308  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  41.49 
 
 
421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  42.57 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  42.57 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  43.11 
 
 
417 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  44.16 
 
 
408 aa  299  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  41.04 
 
 
421 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  42.07 
 
 
401 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  42.37 
 
 
428 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  42.79 
 
 
420 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  43.55 
 
 
424 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  41.65 
 
 
403 aa  293  6e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  40.77 
 
 
421 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  41.32 
 
 
380 aa  276  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  40.11 
 
 
380 aa  269  7e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  43.23 
 
 
450 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  39.21 
 
 
388 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  39.12 
 
 
403 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  39.49 
 
 
379 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  36.7 
 
 
405 aa  219  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  40.92 
 
 
389 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  37.42 
 
 
398 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  39.17 
 
 
379 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  39.82 
 
 
387 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  35.34 
 
 
393 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  39.82 
 
 
398 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  31.49 
 
 
382 aa  209  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  38.74 
 
 
387 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29 
 
 
383 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  34.78 
 
 
369 aa  194  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  29.82 
 
 
389 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  33.33 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  35.47 
 
 
385 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.5 
 
 
384 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  34.88 
 
 
424 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  36.15 
 
 
400 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  33.84 
 
 
382 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  31.44 
 
 
388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  34.65 
 
 
386 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  33.93 
 
 
399 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  32.31 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  32.31 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  32.4 
 
 
385 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  36.15 
 
 
385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  36.15 
 
 
385 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  32.1 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  33.75 
 
 
390 aa  163  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  31.97 
 
 
405 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  33.67 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  30.46 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  27.78 
 
 
417 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  28.92 
 
 
388 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  30.29 
 
 
386 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  28.71 
 
 
411 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  29.02 
 
 
400 aa  89.7  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  26.8 
 
 
315 aa  87  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  25.82 
 
 
312 aa  87  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.24 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  28.29 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  28.29 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  28.29 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  25.72 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  23.44 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.44 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.84 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  26.06 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  25 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  24.49 
 
 
562 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  26.5 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  28.16 
 
 
479 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  23.31 
 
 
409 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  22.34 
 
 
368 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.96 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  23.42 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  21.23 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  25.49 
 
 
279 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  24.77 
 
 
369 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  25.94 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  19.85 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0672  HK97 family phage major capsid protein  27.96 
 
 
506 aa  44.3  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  21.03 
 
 
435 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  33.33 
 
 
385 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>