97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2096 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  100 
 
 		 418 aa  837    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  79.9 
 
 		 431 aa  690    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  77 
 
 		 417 aa  640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  75.85 
 
 		 416 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  70.77 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  68.84 
 
 		 417 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  64.3 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  63.57 
 
 		 421 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  61.19 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  61.85 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  59.38 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  63.81 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  59.76 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  61.15 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  55.75 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  54.39 
 
 		 403 aa  434  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  46.52 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  48.83 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  44.28 
 
 		 425 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  44.97 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  44.95 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  43.1 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  46.53 
 
 		 401 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  46.53 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  41.79 
 
 		 416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  51.89 
 
 		 380 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  45.16 
 
 		 401 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  41.2 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  43.01 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  45.18 
 
 		 380 aa  292  8e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  41.67 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  43.49 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  45.05 
 
 		 387 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  45.6 
 
 		 398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  45.33 
 
 		 387 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  41.96 
 
 		 450 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  38.42 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  34.77 
 
 		 399 aa  231  3e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  37.43 
 
 		 389 aa  216  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  32.01 
 
 		 382 aa  213  5.999999999999999e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  36.89 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  36.89 
 
 		 382 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  29.68 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  36.11 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  33.03 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  35.2 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  36.13 
 
 		 389 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  37.79 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  34.96 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  35.44 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  33.14 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  35.4 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  35.4 
 
 		 385 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  35.11 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  31.84 
 
 		 369 aa  175  1.9999999999999998e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  33.33 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  33.14 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  34.57 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  32.32 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  35 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  34.38 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  31.57 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.54 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  30.25 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  31.25 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  25.59 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  24.04 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28.92 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  27.35 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  25.8 
 
 		 315 aa  97.1  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  27.86 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  24.54 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  26.47 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  24.63 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.75 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  24.62 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  27.74 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  22.55 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  22.55 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  22.55 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  24.41 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  22.31 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  28.04 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.47 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  23.47 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  28.38 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  28.38 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2995  phage major capsid protein, gp36  24.6 
 
 		 369 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.100977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  24.01 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  25.45 
 
 		 403 aa  50.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  25 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  23.84 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  25 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  22.39 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4002  phage major capsid protein, HK97 family  24.68 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  25.26 
 
 		 466 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>